坞时，朝臣们在西长安的城门外为他置酒饯行，董卓令下搭起帐篷与群臣畅饮。席间，他突然令人押上在北地郡诱降捕获的反叛士卒和百姓数百人，当着众多王公大臣的面施以酷刑：先割去，然后或砍其手足，或剜其双目，或放在大锅里烹煮。受刑未死之人，在宴席桌案下挣扎哀号，文武百官无不被前的惨景惊得浑发抖，拿不住筷，惟董卓坐在那里又吃又喝，像是在自享其乐。掌天文和历法的太史官观察天象，说要有大臣死在董卓手里了。果然有以前当过太尉、现为九卿之一卫尉的张温，平日因看不惯董卓的骄横跋扈，颇受董卓怨恨，这次因天象有变，董卓为了搪，便造罪名说张温与袁术勾结谋反，于是张温就被鞭杖活活打死了。在董卓专权的不长时间里，以严酷的法令和残忍的刑罚，制造了大量冤案，枉死者成百上千，致使天下民怨沸腾。他还凭借权势为所为，将中铜人和悬挂钟磬的。。全打坏，改变自汉武帝以来数百年间通的五铢钱币制度，另铸为五分小钱，上面没有纹和文字，周边和中间的孔也无廓，不作磨冶加工，糙不堪，结果造成钱币贬值、价猛涨的严重后果，一斛谷竟卖数十万钱，从此以后商业凋敝。

献帝初平三年(192)四月，司徒王允、尚书仆士孙瑞和董卓将吕布共同商定诛杀逆臣董卓。此时正巧献帝患病新愈，传诏在未央殿会见群臣。吕布派他的同乡亲信、骑都尉李肃带士兵十几人，打扮成中卫士的模样把守在门，吕布怀中藏着诛杀董卓的诏书。董卓门后，李肃率伏兵一拥而上举刀枪击杀，董卓措手不及，惊呼：“吕布何在？快来救我！”吕布转应声喝：“皇帝有诏令杀贼臣董卓！”随即杀死董卓，夷灭三族。朝中主簿田景赶扑向董卓的尸，也被吕布杀掉。这样连杀董卓的亲信三人，其他人皆畏惧不敢动弹。长安城的官吏百姓闻听董卓被诛，都庆贺诛灭国贼。平日投靠奉迎董卓的官吏被一个个抓监狱以死刑。当初，董卓的女婿、中郎将辅率军驻守陕县一带，又派他手下的校尉李莈、郭汜、张济等人分别占据陈留、颍川二郡的一些县。董卓被杀后，吕布派李肃持献帝的诏书去陕县，想借皇威杀掉辅。不料辅等人作困兽斗，带领下与李肃拼杀。李肃边兵少，败退到弘农郡。吕布闻讯大怒，以贻误军机的罪名死李肃。这之后不久的一个晚上，辅军中有些士兵看到没有路而开小差，军营里人心不安。辅心虚，以为下将要反叛，急带着金银宝，叫上边亲信攴胡赤儿等五六人悄悄溜军营，翻越城墙后北渡黄河仓惶逃去。哪知相随的攴胡赤儿等人见辅携带的金银宝甚多，竟起贪心。他们杀掉辅，瓜分其金银宝，并把辅的首级送到长安邀功。等到李莈几个得知朝中政局的变赶回陕县老巢时，辅已被杀。众人因无首领而打算就此散伙各回老家。一想朝廷并无赦书对他们免罪，跑回家去也不行，又听说长安城中文武百官恨透了董卓及其属，发誓要杀光凉州人，这越发使他们惶然不知所措。最后他们接受了贾诩的计策，聚拢各兵向西直奔长安，沿途又收编董卓下不少人，等到达长安城下时，已经有浩浩十几万人了。他们与董卓旧樊稠、李蒙、王方等合兵围攻长安城。

十日后长安被攻破，又和吕布在城中展开激战，最后吕布败走。李莈等人纵兵疯狂抢掠长安财富，对全城男女老少不分官吏百姓大肆杀戮。一时间长安城尸首狼藉，死者不可胜数。同时大肆捕杀参与诛杀董卓的人，司徒王允也被杀死陈尸街。叛军还收殓董卓的尸骨送到。。地安葬，葬礼间大风暴雨震憾董卓墓，雨墓，把董卓的棺材冲了来。长安既占，李莈当了车骑将军，封池侯，领司隶校尉，统领全国兵；郭汜为后将军，封侯；樊稠为右将军，封为万年侯。李莈、郭汜、樊稠三人挟持天，控制了朝政。张济当了骠骑将军，封平侯，领兵驻守弘农，拱卫长安。这一年，西北的韩遂、腾向朝廷投降，各率其属来到长安。朝廷任命韩遂为镇西将军，率本回凉州驻守；任命腾为征西将军，率本驻守。。县。朝廷里侍中宇和谏议大夫邵、右中郎将刘范等人暗中谋划，准备让腾率兵自。。县偷袭长安，他们在朝中为内应，一举消灭李莈等叛军首领。不料在腾兵到距长安只有五十里的长平观时，里应外合的秘密，宇等人仓惶逃向槐里县，樊稠率兵迎击腾。

腾失去内应，无心恋战，败退引军返回凉州。樊稠乘胜攻槐里县，宇、邵、刘范等人均被杀。当时渭域长安周围的三辅地区尚有百姓数十万，是一比较富庶的地方，李莈等叛将纵容下肆意劫掠百姓，洗劫城邑，百姓饥饿困苦，两年之内，现了人吃人的现象，以致于人烟绝迹。叛军首领因争权夺势而内讧，先是李莈杀掉了樊稠，将他的人收归自己麾下。继而郭汜与李莈又互相猜疑，并在长安城中各自拥兵展开拼杀。李莈把天扣押在他的军营里人质，纵兵放火烧毁官殿和城门，又把府库抢掠一空，从皇帝的车服饰到其他廷御金银财宝统统归于己有。其后，他便不断派文武百官到郭汜那里去说和，以求双方罢兵。郭汜不愿与他讲和，把受李莈迫前来说和的文武官员都关了起来。两人相互争斗数月之久，其属相互残杀不下万余人。李莈的将杨奉和军吏宋果密谋杀掉李莈，由于谋划不周，事情败，于是杨奉带领自己统辖的一支兵叛离李莈而去。李莈失去杨奉一支兵，实力受到一定的影响。驻扎在弘农的张济此时也来长安从中调解，这样李莈才答应把扣押的献帝放来。献帝逃叛将之手，不敢在长安停留，匆匆来到新丰、霸陵间。郭汜见机，又想把献帝胁迫到。。城，控制在他的手中。献帝赶到杨奉营中避难。杨奉发兵向郭汜攻，郭汜兵败，向南山一带退走。杨奉和将军董承保护献帝及文武百官还都洛。这时李莈、郭汜都后悔不该把献帝放走，于是两军又联合起来，集中兵力向弘农郡的曹涧一带追击杨奉。杨奉见李、郭人多势众，料难抵挡，便急向河东的白波军求援。白波军将领韩暹、胡才、李乐等赶来救援。

杨奉指挥军队与李莈、郭汜大战于曹涧，结果败退。李、郭纵兵杀戮文武百官，然后带着劫掠的后嫔妃返回弘农。献帝逃到陕县，又向北渡过黄河，车全无，只得徒步行走，边只有皇后与贵人。一直到了黄河北边的大县，才找到一房住了下来。杨奉、韩暹追踪找到献帝后，只好暂且以安邑县治为都城让他住下来，也只能坐车，边仅有太尉杨彪、太仆韩及随从十余人。献帝分别拜韩暹、胡才、李乐三人为征东、征西、征北将军，让他们与杨奉、董承共掌朝政。又派太仆韩前往弘农与李莈、郭汜谈判，索回了被他们掠走的人和文武百官，献帝的乘舆车也要回了一些。这一年黄河以北地区蝗灾肆，加上长时间大旱不雨，农田几乎颗粒无收。朝廷在安邑一带筹集不到粮，群臣没有饭吃，只好到外摘青枣，或到田间挖些野菜充饥。军队也断了粮饷，士兵们开始动，将领们无法控制不满情绪。无奈，杨奉、韩暹、董承等人商议还是应该护送献帝到洛去。献帝和文武朝臣及军队离开安邑，箕关，途经轵，有晋侯张杨携带粮在路边迎接，献帝非常激张杨在困难中的帮助，拜他为大司，此事在《张杨传》中也有记载。献帝和朝廷还都洛后，见这里的殿早已被烧成一片废墟，街陌上也长满了荒草。他们既无粮充饥，又无房屋居住，只得砍去荆棘荒草，在断残墙或土丘旁半躺半卧地歇息。此时各州、郡的长官都拥兵自重，没有哪个来洛朝见献帝。仅有的一粮越来越少，自尚书郎以下的官员们只好每天到郊外寻些野果填腹，不断有人饿死在断墙残垣间。于是太祖曹把献帝迎到许县，将许县为临时都城。韩暹、杨奉不能遵守朝廷礼法，各自带兵离去，在徐州、扬州间窜扰，不久被刘备所擒杀。董承追随太祖一年多时间，也因罪被诛。

建安二年(197)，朝廷派谒者仆裴茂统领关西各路兵讨伐李莈，李莈兵败亡，并被夷灭三族。叛将郭汜被将五习所杀，死在。。城。张济因军中缺粮，带兵到南郡抢掠，在穰县被百姓包围起来杀死，他的侄张绣收聚并统领了他的残。胡才、李乐二人留在河东，后来胡才被他的冤家对谋杀，李乐患病亡。西北的腾、韩遂二人自返回凉州后，越发拥兵自重。腾奉诏朝任卫尉之职后，其属由他的儿超统领。

建安十六年(211)，超、韩遂联合关中诸将共同反叛朝廷，太祖率师西征，大败叛军，此事在《武帝纪》中有详细记载。韩遂兵败逃往金城，被将所杀。超率残退居汉郡。腾因为儿的叛逆大罪而被诛，夷灭三族。又有赵衢等人举义兵讨伐超，超引兵前往汉中依附张鲁，随后投奔刘备，最后死在西蜀。