持节、监司豫冀并四州诸军事、豫州刺史。任命散骑常侍郗昙为北中郎将、持节、都督徐兖青冀幽五州诸军事、徐兖二州刺史，镇守下邳。冬十月乙丑日，陈留王曹劢去世。十一月庚，打雷。辛酉日，地震。十二月，北中郎将荀羡和慕容隽在山荏战，荀羡大败。

三年三月甲辰，下诏书，因为连年打仗，粮草运输跟不上，自王公以下每十三借调一个人帮助运输一年。秋七月，平北将军昌被慕容隽攻，从白逃往荥。冬十月慕容隽侵犯东阿，朝廷派西中郎将谢万驻在下蔡，北中郎将郗昙驻在平，攻打慕容隽，官军大败。十一月戊日，升杨州刺史王述为卫将军。十二月，又任命中军将军、琅邪王丕为骠骑将军，东海王奕为车骑将军。封武陵王晞为梁王。州刺史温放之率领军队讨伐林邑参黎、耽潦，全都降服了他们。

四年正月，仇池公杨俊去世，儿杨世继承爵位。丙戌日，慕容隽死，儿幕容暐继伪位。二月，凤皇带九个小凤凰现在丰城。秋七月，因为频繁打仗和徭役，省减廷膳。八月辛丑初一，日，是全。冬十月，天狗星落于西南。十一月，封太尉桓温为南郡公，弟弟桓冲为丰城县公，儿桓济为临贺郡公。凤凰又现在丰城，有众多的鸟跟随。

五年正月戊戌，大赦，赏赐鳏寡孤独没有生活能力的人每人五斛米。北中郎将、都督徐兖青冀幽五州诸军事、徐兖二州刺史郗昙去世。二月，任命镇军将军范汪为都督徐兖青冀幽五州诸军事、安北将军、徐兖二州刺史。平南将军、广州刺史、夏侯滕去世。夏四月，发大。太尉桓温镇守宛城，派他弟弟桓豁率领队攻取许昌。凤皇现在沔北。五月丁巳，穆皇帝在显殿去世，当时十九岁。安葬在永平陵，庙号孝宗。

哀皇帝名司丕，字千龄，成帝长也。咸康八年封为琅邪王。永和元年援散骑常侍，十二年加授中军将军，升平三年除骠骑将军。

升平五年五月丁巳，穆帝去世。皇太后下令说：“穆帝突然患病不能治，继承人没有立，琅邪王司丕，是中兴王室的正统，德完的宗亲。从前在咸康时应当作太。因为年岁幼小，不足以承担国难，所以显宗成帝让位给康帝。现在亲情名望地位，没有能比得上他的，让琅邪王继承皇统。”于是百官准备好车，到琅邪王的府第去迎接。庚申日，琅邪王即皇帝位，大赦天下。壬戌日，下诏说：“朕得以承受圣明之命，朝接受皇位。想到先王宗庙，祭祀没有主人，太妃哭丧的，空旷没有可以安之，心中十分悲痛，五脏就像割一样痛楚。宗国所尊崇的，情和礼受到同样重视，孙继嗣的重要，情与义没有不同。东海王司奕，是亲近的戚属，应当敬承本族统绪，应以司奕为琅邪王。”秋七月戊午，把穆皇帝安葬在永平陵。慕容恪攻陷野王，守将吕护退保荥。八月己卯日晚上，天空有裂，宽数丈，有雷一般的声音。九月戊申，立皇后王氏。穆帝皇后何氏称永安。吕护反叛，投奔了莫容暐。冬十月，安北将军范汪犯了罪，被废为庶人。十一月丙辰，下诏说：“显宗成皇帝顾命临终时留下遗命，因为时事多难，弘扬世的风教，树立德义博得威重，用以振兴社稷。但是国难不断，康帝穆帝过早地离开人世，继续的国运不盛。朕以寡薄的德行，又继承先王的事业，心中有长久的思慕，悲痛摧折人心。昭穆两个皇帝的大义，原本应遵从上天。继承国家大业，是古今的常。理应上继显宗，用以绵延本族统绪。”十二月，加凉州刺史张玄靓为大都督陇右诸军事、护羌校尉、西平公。

隆和元年正月壬，大赦，改年号。甲寅日，削减田税，每亩收税二升。当月，慕容暐的将领吕护、傅末波攻陷小垒，洛。二月辛未，任命辅国将军、吴国内史庾希为北中郎将、徐兖二州刺史，镇守下邳；任命前锋监军、龙骧将军袁真为西中郎将、监护豫司并冀四州诸军事、豫州刺史，镇汝南，都暂授苻节。丙日，推尊生母亲周氏为皇太妃。三月甲寅初一，日。夏四月，天旱。诏令释放罪轻的囚犯，赈求困乏之人。丁丑日，梁州地震，浩衅有山崩塌。吕护又侵犯洛。乙酉日，辅国将军、河南太守施逃到于宛。五月丁巳日，派北中郎将庾希、竟陵太守邓遐率领军救援洛。秋七月，吕护等人退守小平津。升琅邪王司奕为侍中、骠骑大将军、开府。邓遐驻新城，庾希将何谦和慕容暐将刘则在檀丘战，打败了刘则。八月，西中郎将袁真驻汝南，运送五万斛米以赠送给洛。冬十月，赏赐大米给贫穷的人，每人五斛。章武王司珍去世。十二月戊午初一，日。皇帝下诏说：“军旗征驻守，未能减轻赋税和徭役。天象失度，大旱成灾。难是政事还不和洽，还是有如传说、以及像渭之滨的隐士吗！可访求推举隐士免除严峻繁琐的赋税，周祥地商议法令，全遵循减损之要。”庾希从下邳退守山，袁真从汝南退守寿。