置左右长史、司、从事中郎、掾、属各四人，封宣城王，邑五千，持节、侍中、中书监、录尚书事都仍旧不变。他没有接受，太后下令废黜海陵王，让宗作为太祖的三儿继承其皇位，群臣再三请求敦促，他才接受。

建武元年(494)冬十月二十二日，宗萧鸾即皇帝位。下诏说：“我们大齐自从受禅建国，君临天下，既神且武，光明好，长治久安，固若磐石。不料层统治中途现了麻烦，朝廷现问题，后继的皇上多有失误，各地的祸患时有发生，见伟大的事业就要沉没。宣德皇后鉴于历史教训，遵照历来典章，采纳大家意见，制定英明决策，把国家前途放到我一个人肩上。我这个人能力浅薄，要我来继承大业，上对天，下对万民，想念前辈，我真是战战兢兢，如履薄冰，日夜忧惧，不知该如何是好，我愿意和普天下人开辟新局面。特命大赦天下，改元，为宿卫者普遍提升一级，其他文武官员，赐位二等。所有建武元年以前拖欠的旧债和折换所欠的官家东西，一概予以免除。所有被抄没的叛者家属，也全释放。犯罪被放者，也都放还本乡。”任命太尉王敬则为大司，司空陈显达为太尉，尚书令王晏加骠骑大将军，中领军萧谌为领军将军、南徐州刺史，皇萧宝义为扬州刺史，中护军王玄邈为南兖州刺史，新任命的右将军张瑰为右光禄大夫，平北将军王广之为江州刺史。二十四日，下诏禁止远近各地上献庆礼。二十六日，诏：“从今以后，所有雕文篆刻，岁时光新，全停止。地方长官如果搞祭祀，必须是在自己任职的地域里的才行，否则要严加禁绝。”追赠安陆昭侯萧缅为安陆王。二十八日，任命安陆侯的儿萧宝日至为湘州刺史。下诏说：“近来在职官吏，往往违反规定，谋私害公，这将养成危害人民的蠹虫。从现在起商旅税，石、后渚的各项征税以及征派征盐借用民工等等摊派，一概停息。各地对凡属公家应该征收的项目，要立刻明文规定。主门要详细制定要求内容，有关法律门要明下监察。”

十一月初三，任命西中郎长史始安王萧遥光为扬州刺史，晋寿太守王洪范为青、冀二州刺史，尚书令王晏领太少傅。四日，给大司寻公王敬则等十三人各晋封爵位和邑不一。下诏取消新林苑，土地皆还原主，原欠债务作价抵销。十日，立皇萧宝义为晋安王，萧宝玄为江夏王，萧宝源为庐陵王，萧宝寅为建安王，萧宝为随郡王，萧宝攸为南平王。十四日，下诏说：“乡镇负责人俸禄微薄，不够代替田，虽然当地经常有所供给，也很劳费，从现在起全都取消。”又下诏“宣城国五品以上官员都优等政绩予以晋升奖励。五品以下，都可随便自寻去。有愿意官的，可据其兴趣作适当安排。”十五日，追尊始安贞王为景皇，妃为懿后。十六日，任命辅国将军闻喜公萧遥欣为荆州刺史，宁朔将军丰城公萧遥昌为豫州刺史。十七日，下诏：“中署、材官、车府等的巧工匠，允许分期分批替放假休息。”十八日，立萧宝卷为皇太，赐天下为父后的人爵一级，孝顺孙义夫节妇，普遍予以奖励和表彰。住宅贴上光荣榜，并赐给南齐书束帛。”十九日，下诏：“太初立，各地有的送来庆礼，应该一律停止。”二十二日，任命新上任的征虏将军江夏王萧宝玄为郢州刺史。永明年间，御史中丞沈渊曾上表反映百官年龄一到七十岁，都令他们退休了，他们在家里很穷困。三十日，下诏说：“近日允许各门老年官员自己提要求，东西二省的官员，还有些俸禄，一旦退休了，便荣誉和收都没有了，为了现老的神和同情的心情，对到达退休年龄的官员，一律照永明七年以前的晋升奖赏办法办理。”对皇上在辅政期间诛杀的各位宗王，都在这个月里恢复了地位，并封他们的儿为侯。

十二月十二日，下诏说：“光凭在上层观察政治难免有遗漏，而在下层的不容易把意见反映上来。所以古人歌颂《甘棠》诗是赞察民情，咏赞肺石是希望能允许提意见。以后我每月要看一次有关报告，如有冤者未予申平的，正直者没被举荐的，有关门要承担责任。”

建武二年(495)正月初一，下诏“京师在押囚犯，已判死刑的，降为五年徒刑。三署在押囚徒已判五年以下徒刑的，全都释放。王公以下官员，都要推荐人才。并和王公卿士内外群僚一起，指我的缺错误，可以肆无忌惮地提意见。”索虏寇掠司、豫、徐、梁四州。初二，派遣镇南将军王广之督师司州征讨，右卫将军萧坦之督师徐州征讨，尚书右仆沈文季督师豫州征讨。初九，下诏对京师两县被毁被挖的坟垅行适当修理。又下诏说：“民以为天，蚕是生活之本，这是古代圣王极为重视的，前哲的典范便是后王的准则，这是我们一切工作的发。我居皇位，心怀天下，日理万机，不暇休息，早晚考虑，坐卧不忘。各地长官是百姓的主人，负有调理风俗的职责，应该严格对待