十二月初四，上国、夏州总、任城郡公王景因罪被杀。

这月，祖从京城到仁寿，设置十二所行。

开皇十九年(599)正月初七，大赦天下囚犯。

十二日，在武德殿博，祖设宴款待百官。

二月初四，晋王杨广来朝。

初六，任命并州总长史宇文弼为朔州总。

十九日，祖巡幸仁寿。

四月初二，突厥利可归附。

达可汗侵犯边，祖派遣行军总史万岁打败了他。

六月初三，祖任命豫章王杨日柬为内史令。

八月初十，上国、尚书左仆、齐国公赹因罪被罢免官职。

十八日，上国、皖城郡公张威去世。

二十一日，上国、城郡公李彻去世。

九月初三，任命太常卿弘为吏尚书。

十月初二，任命突厥利可汗为启人可汗，在其落修筑大利城。

初八，任命朔州总宇文弼为代州总。

十二月初一，突厥都蓝可汗被下所杀。

初四，有星落于渤海。

开皇二十年(600)正月初一，祖居仁寿。

突厥、丽、契丹都派遣使者上贡土产。

初三，任命代州总宇文弼为吴州总。

二月初十，任命上国崔弘度为原州总。

十八日，没有乌云，而现雷声。

三月初二，熙州人李英林谋反，祖派遣行军总张衡平息了他。

四月初四，突厥犯边，祖任命晋王杨广为行军元帅，打败了他。

十七日，天空有声如泻，从南到北响起。

六月初十，秦王杨俊去世。

八月，现老人星。

九月二十一日，祖从仁寿还。

二十七日，吴州总杨异去世。

十月初三，白天现太白星。

初九，皇太杨勇及诸一起被废为庶民。

杀国、太平县公史万岁。

十三日，杀左卫大将军、五原郡公元。。

十一月初三，地震，京城大风雪。

祖立晋王杨广为皇太。

十二月初三，下令东官属不得对皇太称臣。

二十六日，下诏严禁毁坏或偷盗佛、天尊、岳镇、海渎等神像，对沙门毁坏佛像，士毁坏天尊像的，罪加一等。

祖仁寿元年(601)正月初一，大赦天下囚犯，改元。

任命尚书右仆杨素为尚书左仆，纳言苏威为尚书右仆。

十三日，迁河南王杨昭为晋王。

突厥侵犯恒安，祖派遣国韩洪攻打他们，官军失败。

任命晋王杨昭为内史令。

十七日，祖下诏对今后阵亡的将士，修坟造墓。

二月初一，现日蚀。

二十七日，祖任命上国独孤楷为原州总。

三月初九，祖任命豫章王杨日柬为扬州总。

四月，祖任命淅州刺史苏孝慈为洪州总。

五月初七，突厥九万男女来投降。

初十，雨暴雷急，大风起树木，宜君湫移到始平。

六月初一，洪州总苏孝慈去世。

初三，祖派遣十六位使臣巡视民风。

十三日，祖下诏减学校。

于是国学只留学生七十人，太学、四门及州县的学校一起废除。

这天，给各州颁发舍利。

七月十七日，改国监为太学。

九月初三，任命国杜彦为云州总。

十一月初九，祖在南郊祭祀。

十二日，任命资州刺史卫玄为遂州总。

仁寿二年(602)二月初三，祖任命邢州刺史侯莫陈繦为桂州总，宗正杨祀为荆州总。

三月二十一日，祖巡幸仁寿。

二十四日，任命齐州刺史张乔为潭州总。