决定国家的大政方针，陛下恭谨地继承国家大计，可以说是用变通的办法来理国事，几乎没有偏离过它。从那时到现在已有三个月了，有时反而不能对选择逆与顺、名与实的事情抱有疑问，我暗自为陛下忧虑这些事情。如有可托辞的话，也只能说陛下的心事，即位前的时候不曾有过谋求皇位的计划，今天不曾忘记思念亲人的心情，这就是所以实行变通的办法而没有偏离过正的本所在。充满不曾谋取皇位的心事，以竭尽负罪引咎自责的诚意，充满不曾忘记亲人之心，以尽冬温夏凉早晚问安侍奉父母之礼，而父之间的理完全适当了，本也就确立了。”再次当面向皇帝辞谢待制、侍讲的官职，皇帝亲自写信说：“你研究经术学问有很的底，正好借用它来给帝王讲经劝勉、从中答对的职务，不要再苦苦推辞了，以符合我崇尚儒学、尊重大的心意。”于是朱熹接受了任命。

恰逢赵彦逾巡视孝宗陵墓，认为那里土层浅薄，下面有和石。孙逢吉重新去巡视，要求另外寻找吉利的地方。皇帝下圣旨要大家讨论，御史台的官吏们害怕讨论这件事，讨论中途停止。朱熹却上奏章议论说“：寿皇(孝宗)有至至上的德行，埋藏孝宗衣冠的地方，应当广泛地寻访探察有名的山脉，不应该偏信御史台官吏的话，把孝宗的陵墓埋葬在泉沙砾之中。”没有得到答复。当时议论的人认为皇帝没有回到皇大内，那么名实不正而疑议产生；况且金国的使臣要来，会有所窥察暗访，皇帝下圣旨修缮原来的东，修造房屋三百多间，打算搬去住在里面。朱熹上奏疏说：

“这一定是陛下左右亲近幸的小人倡导编造这一说教来蛊惑、误导陛下，而想通过这件事来实现他们的邪用心。我担心不但上帝会震动发怒，灾害怪异多有现，正当恐惧反省修养自的时候，不应当兴造这个大工程，以违悖上天谴责时所告诫的惊动众人的用意；我也担心京城地区百姓饥饿迫离失所、临近死亡的边缘，或许有人会怨怒忿恨，因而发生其他变故。不仅无法通太上皇帝的心意，以致没有见太上皇帝的日期，我也担心孝宗皇帝大殓后没有埋葬，因为孝宗陵墓的位置还没有占卜确定，灵位前的供奉不允许稍有弛缓，太皇太后、皇太后都已到了受人尊敬的龄，孤独之陷于忧愁困苦之中，早晚奉养尤其不可缺少。然而全国各地的百姓，只见陛下急切地要大量修造朝殿堂，迅速建成，一旦轻快自得地丢弃这里而去太殿，迁到安适方便的地方，将士百姓心中将会有愤愤不平的地方。前车之鉴不远，这是应该到特别可怕的。

“我又听说太上皇后恐怕违逆太上皇帝的圣意，不想让他听到太上皇的称呼，又不想让他听到关于内禅的说法，这又思虑过分了。难不知如果是这样的话，而不是婉转地告知，那么父之间，上面怨恨愤怒而下面忧愁恐惧，到什么时候才能了结。父之间这一大的理常，是君臣、父、夫妻之三纲所关系的大事，长久地拖下去而不去解决它，也可能会有假借父大的理来制造谣言横生事端的人，这又是我十分恐惧的原因。我希望陛下明确地诏示大臣，首先停止修缮东工程，而把修缮东的人工材料回慈福、重华之间，简单地建造可供休息的殿房一二十间，使它大概虎虎可以居住就行了。至于搬到皇去的打算，我又希望陛下须下诏书责备自己，减省行时的车卫队，之后，暂时改变衣服颜，如同唐肃宗一样改穿紫的袍，在前面拉着缰绳驾驭匹，以表明负罪引咎的诚意，那么太上皇帝虽然有忿怒的情绪，也会迅速消散，而父之间的情也就洽地合谐了。

“至于像朝廷的纪律规章纲常法度，我又希望陛下下诏切地告诫自己左右亲近的人，不要预朝政。其中确实有功劳而所得到的褒奖赏赐未能满足公众议论的人，也诏令大臣们共同讨论他们的功绩，考查奖赏功德的制度，重重地犒赏他们的功劳。而且凡是号令的弛与张，人才的用和罢免，就全把它委托给二、三个大臣，要求他们反复比较衡量，不要固执己见，斟酌采取公论，上奏皇帝而后实行这些决定。有不恰当的地方，把它给大家辩驳讨论，选择好的意见由皇帝最后的决定，那么不仅皇帝左右亲近幸的人不能预朝政大权，大臣们也不能专门任用自己的亲信私党，而陛下也得以更加明白熟悉天下的政事，而对得失的计算也就没有什么疑问了。

“对于像孝宗陵墓的占卜选择，我希望陛下废除御史台官吏的意见，另外寻找野外地区，以营造新的陵墓，使孝宗皇帝的遗能够安稳地寝居于内，而国家和百姓都蒙受福佑于外了。”

朱熹这奏章呈之后没有得到答复，然而皇帝也没有生朱熹气的意思，每次给皇帝所讲的内容，朱熹都次序编成册给皇帝，皇帝也以宽大的怀容纳了。

朱熹在上奏劝勉皇帝一步提德行时说“：我希望陛下在使用日常费用的时候，以求得放心作为本，而在研习经书观看史籍时，与儒学多多亲近，多用一些功夫。多召见大臣，切磋治理国家的方法措施，大臣们殿奏对时，也和颜悦地对待他们，反复询问探访，用来求政事的得失，民情的忧乐，而又据这些问题来考察官吏的邪正直和长短，这样也许能使天下之事各自得到合适的理了。”朱熹上奏说“：礼经敕令规定，儿为父亲、嫡孙代父亲为祖父服丧，都要服丧三年；嫡应当为自己父亲服丧，因故不能执绋服丧，就由嫡孙继承大统而代替父亲执绋服丧。自从汉文帝减少服丧的期限，历代因袭这一期限，于是天没有三年的丧期。为父服丧尚且如此，那嫡孙代父服丧更是可想而知了。人的立世之废弃衰坏，君臣、父、夫妻三纲不明白，一千多年以来，没能加以考正清楚。孝宗皇帝孝亲之情来自上天，一个月之外，还是服执通行的全丧礼，上朝穿的衣服帽都是用布制的，这孝行应该显著地记录在典籍中，成为孙万代的法则。近来，孝宗皇帝的遗诰刚刚颁布，太上皇帝偶然到不适，不能亲自参加丧礼。陛下以嫡孙继承帝位，那么承受丧祭重任的嫡孙所应服的丧礼已著明在礼律中，所以应该遵循孝宗皇帝已经实行的方法。一时仓促行事，来不及详细讨论，于是用了漆纱浅黄的衣服，不仅仅对上违背礼仪规定，而且使孝宗皇帝已经实行的丧礼反而重新遭到破坏，我暗暗为此到痛心。然而已往的过失来不及追改了，只有将来孝宗皇帝灵柩启行时，丧礼应当重新沿用初丧时的服。”