前囤地势太险无法逾越，命令孔英率领劲兵猛攻后囤。天气老是下雨，将士们在泥淖中苦战。六月四日，天气忽然晴朗，刘纟廷先士卒，攻克土城。杨应龙觉更加迫，散发金招募死士为他抗拒官军，没人响应。杨应龙起，提着刀到堡垒上巡视，看见四面火光冲天，大批官军已登上囤，攻破土城杀了来。杨应龙便仓皇地同二个妾一起在室内自缢，并引火自焚。吴广抓获了杨应龙的儿杨朝栋，急忙寻找到杨应龙的尸，冲火焰。贼人的叛终于平息。

从师到消灭贼人历时一百一十四天，八路大军共斩敌人首级二万多个，活捉杨朝栋等一百多人。李化龙将此大捷公开上报，将俘虏献到朝廷，用锉磋磨杨应龙的尸，将杨朝栋、杨兆龙等人在闹市车裂。播州从唐朝归杨氏，传了二十九代，达八百多年之久，到杨应龙手上终于灭亡。

三十一年(1603)，播州残余的逆贼吴洪、卢文秀等人又发生叛，总兵李应祥等人带兵讨伐平定了他们。朝廷于是便将播州一分为二：属四川的分称为遵义府；属贵州的这一分称为平越府。

永宁，唐朝时称为蔺州。宋朝时，该地在泸州的江安、合江二个县的境内。元朝时，此地设置了永宁路，统领了筠连州和腾川县，后来此地又改为永宁宣抚司。

明朝洪武四年(1371)平定了四川，永宁归附朝廷，朝廷在此设置永宁卫。六年，筠连州滕大寨的蛮人编张等发动叛，伪称自己是云南的官军，占领了湖南长宁各州县，朝廷命成都卫指挥袁洪前去讨伐。袁洪带兵到叙州的庆符县，攻破了清平关，活捉了他们自封的千李文质等人。编张逃走后，又带兵犯江安各县。袁洪带兵追击，又打败了他们，焚烧了他们九个寨，俘获编张的儿、自封的镇抚张寿。编张逃跑后藏匿在溪里，他的余党散云南。皇帝听到报告以后，赐谕给袁洪说：“南方的蛮族人时而叛时而又归顺没有一定的准则，对他们不足以加罪。既然已经抓获了俘虏，就将这些俘虏编军队之中，驻扎在边境之上。对待他们就是要以军队震慑，使他们对我天朝的威风有所畏惧，这样就不会留下后患。”不久，编张又聚众占领了滕大寨，袁洪带兵讨伐并打败了他们，追到小芒时，编张逃跑了，于是攻取了得寨，活捉了阿普等人。从此以后，编张再也不敢来了，他们的寨也都被扫平。于是朝廷便把筠连州降为县，让其隶属于叙州，将九姓长官司隶属于永宁安抚司。

七年(1374)朝廷将永宁等军民安抚司升为宣抚使司，官秩为正三品。八年，朝廷任命禄照为宣抚使。十七年，永宁宣抚使禄照向朝廷献贡，皇帝下诏赏赐给他钱钞、冠和衣服，规定他们每三年向朝廷贡一次。十八年，禄照派他的弟弟阿居来朝觐皇帝，说近年来应该纳的赋都已纳了，只有粮无法如数完成。原因是大军向南征讨，蛮族百姓惊慌逃窜，无法时耕，加上打仗以后疾病瘟疫行，死亡的人很多，所以来不及收缴和运送粮。皇帝下令蠲免。二十三年，永宁宣抚上奏说，他所辖的地盘内有一百九十滩，其中的江门大滩有八十一，石都将堵了。皇帝下诏书，命令景川侯曹震前去开凿疏通。二十四年，曹震到泸州巡察，看到有支通往永宁，便凿去石、削平崖、疏通河以通漕运。

二十六年(1393)，禄照的儿阿聂继承其父的职务。此前，禄照因犯法被逮到京城，在他向朝廷申述清楚后回去时，死在途中。这时禄照的儿阿聂和弟弟阿智都在太学里学习，于是朝廷便让阿聂的庶母奢尾掌宣抚使司的事务。到二十六年时奢尾京朝觐，请求朝廷让阿聂继承其父的职务，皇帝同意了。永乐四年(1406)，朝廷免除了永宁荒田的租赋。

宣德八年(1433)，已故宣抚阿聂的妻奢苏京朝觐献贡。九年，宣抚奢苏上奏说“：我们这里学习儒学的学生都是当地的僚族人，朝廷所教授的官话他们听不通，因此难以训诲他们。永宁的监生李源资质厚学识贯通，请求朝廷比照云南鹤庆府的例，授予他儒学训导。”皇帝下诏同意这个建议。景泰二年(1451)，朝廷同意了布政司的请求，减免了永宁宣抚司的税课和分钱钞，因该地苗族人悄悄作，客商不通，路途阻绝的缘故。