诫他的侄不要忘记何先生。李锦从这以后不曾有过不规矩的动机。

自成在天下造反二十年，攻陷皇都，颠覆庙社，他的几十万士兵最终全归附了腾蛟。而腾蛟上书只说罪魁祸首已除掉，稍微发了神灵的一怨气，应该到郊庙去祭告神灵，始终不谈自己的功劳。唐王非常兴，立刻任命他为东阁大学士兼兵尚书，加封他为定兴伯，仍然统帅军队，但是心中怀疑自成之死不真实。腾蛟肯定自成死了，尸都已经腐烂了。腾蛟不敢以有功自居，因而决辞谢给自己加封的爵位。唐王不准他辞谢，命令他谋划攻取江西以及南都。

在这个时候，投诚的士兵已经很多了，腾蛟打算把原有的队掺他们中间去，于是题写、授予朝宣、先璧为总兵官，与承胤、赤心、郝永忠、宗第、才以及董英、忠、士秀、曹志建、王允成、卢鼎等一并在湖南、湖北开设军镇，这就是当时所说的十三镇。永忠就是摇旗，董英是腾蛟的中军，志建是以前的巡抚刘熙祚的中军，其余的都是良玉的旧将领。

腾蛟态度决地想举兵东下，就上表给唐王要求兵作战。第二年正月与监军御史李鹰品率先开赴湘，约定时期与其他将领在岳州大会合。先璧在原地逗留不肯赶来，其他的各军也在相互观望，只有赤心从湖北到来，被大清兵打败，然后返回，各镇的兵于是都成了泡影了，腾蛟的威望也因此受到损害。当时各位将领都骄横贪婪而且残忍，朝宣尤其突，他抢劫了人还要剥掉人，永忠也仿效他，没有一天不杀人，腾蛟不能制止他们。旧总督杨鹗过去因克扣军饷失去军心，现在又向上结当了偏沅总督。腾蛟对此说了话，朝廷才把杨鹗召回。

唐王多次讨论关，被郑氏阻止。腾蛟屡次请求唐王亲临江西，以便联合力量攻取江西。唐王派遣使者来征集兵力，腾蛟派永忠的锐骑兵五千人前去应征。永忠不肯前去，五月份才抵达郴州。恰好大清兵攻下汀州，聿键被俘而死，赣州也失陷了。腾蛟听说唐王去世，非常悲恸，但还是像平常一样整治军队保守边境。

后来听说永明王即位，心里才稍稍安静下来。不久永明王让腾蛟武英殿大学士，加封太太保。王才本来在把守益，听说大清兵渐渐近，竟然回到长沙去了。

四年天，才扬言缺乏军饷，在当地大肆抢劫，并且一直抢到湘。恰好大清兵到达长沙，才逃往湖北。腾蛟不能把守，单枪匹逃往衡州，长沙、湘一同失陷。卢鼎此时把守衡州，而先璧的军队突然到来，大肆掳掠。卢鼎不能抵抗，逃到永州。先璧于是挟持腾蛟到祁，又从小路到辰州。腾蛟半逃脱回来，到了永州。立足未稳，卢鼎下的将领也开始大肆抢劫。卢鼎逃往州，腾蛟与侍郎严起恒跑到了白牙市，大清兵于是拿下了衡州和永州。当初，腾蛟建立十三个军镇用来保卫长沙，到现在各军都自己了盗贼，谈什么保卫国家呢？大清兵衡州，守将黄朝宣投降了。大清兵列举他的罪行，把他肢解了，周围地区的人民都拍手称快。大清政府让一个知府把守永州，副将周金汤探察到守城力量薄弱，夜间率兵击鼓大喊着登上城墙，知府弃城逃跑，金汤于是了永州。

六月，腾蛟在白牙。永明王暗中派遣中使告诉他刘承胤的罪行，命令他到武冈除掉他。腾蛟于是前去拜见永明王，永明王和王太后都召见了他。承胤起初是一个小校，凭腾蛟推荐到了大将，现在已经渐渐地骄傲起来。腾蛟在长沙征调他的兵力，承胤非常愤怒，说：“你以前调遣朝宣、先璧的军队时，都是章旷亲自过去说好话，现在倒来军令使唤我。”于是派骑兵到黎平，抓住腾蛟的儿人质，向他勒索了几万饷银。腾蛟的儿逃跑回来告诉他，腾蛟派遣章旷去，承胤才会率领军队来。腾蛟并且同他约为儿女亲家，承胤这一来更加骄横。到这时加封爵号为安国公，勋阶为上国，赐了他尚方宝剑，他更加坐地自大。承胤忌妒腾蛟位置在自己之上，想夺取他的权力，请求朝廷封他尚书，专门理粮饷，永明王没有同意他的建议。永明王召见腾蛟谋划收拾承胤，但腾蛟没有兵力，永明王就命令把云南援将赵印选、胡一青兵力给他。等到他辞别时，又赐给他银币，命令朝廷大臣在郊外为他饯行。承胤埋伏了一千骑兵袭击腾蛟，印选的士兵奋力作战，全歼灭了他们，腾蛟才得以返回到白牙驻守。

八月，大清兵打下武冈，承胤投降了。永明王先逃往靖州，后来又到了柳州。当时常德、宝庆已经丢掉了，永州也再次陷落。永明王打算返回桂林，而桂林城中只有焦琏的微弱兵力，腾蛟率领印选、一青的队城支援他们。可是南安侯郝永忠也突然带着一万多兵力到来，打算同焦琏的军队作战，恰好宜章伯卢鼎的军队也到了，腾蛟三下里为他们相互调剂，桂林才安定下来。于是腾蛟派遣焦琏、永忠、卢鼎、印选、一青分别把守兴安、灵川、永宁、义宁各州县，腾蛟率领五位将领联合抵御。