辅臣的意义在于分国事，替朕分担忧愁。现在这局面，为何不代朕传一句话，平息各意见纠纷，君臣之间的大义到哪里去了？’又说：‘朕不能忍受侮辱待，六七天都在日夜哭泣。’方从哲是顾命元老重臣，假使他能稍微有所行动，何至于让至尊的皇帝如此忧愤危险！他阿谀奉承太监是那么多，皇帝的圣明是如此少，所以胆敢侮辱皇帝的祖先，违抗皇帝的父亲，而欺负皇帝陛下啊。”最后又极力说明黄克缵的荒谬。二疏章一起朝廷讨论。不久上报皇帝，只是将李可灼下狱发边地，方从哲不问罪。

山东巡抚报告，五月中旬，大白天月亮和星星一齐现了。孙慎行以为非常怪异，上疏请求皇帝修反省，语言非常直率中肯。秦王朱谊氵患由庶受封，排行老四规矩不应该封为郡王，重礼贿赂皇帝近臣，才得圣旨批准。孙慎行决不接受诏书，三次上疏争辩，没有结果。七月称病离职。

这一年冬天，朝廷推举内阁大臣，以孙慎行第一，吏侍郎盛以弘第二。魏忠贤压制不任用，任用顾秉谦、朱国祯、朱延禧、魏广微，朝臣大吃一惊。叶向接连上疏请求任用孙、盛二人，最终没有效果。此后，魏忠贤气焰嚣张，讨论编写《三朝要典》，孙慎行列为“红案”的首犯。同党张讷于是上疏极力诋毁，下诏剥夺官籍。不久，刘志选又两次上疏追查揭发，下诏抚调查审讯，发宁夏充边，没有发，庄烈皇帝即位，赦免了他。

崇祯元年(1628)命令以原来官职协助治理詹事府，极力推辞不到任。孙慎行守严峻，品行纯洁，为一代官吏之宗师。朝士多数推举他内阁，吏尚书王永光极力排斥他，终究不被任用。八年，推举内阁大臣，几次皇帝都不满意。最后把孙慎行、刘宗周、林钅的名字上报，皇帝立即召见他们。孙慎行已经患病，刚到北京就死了。赠封太太保，谥号文介。

攀龙，字存之，无锡人。少年时读书，就喜好程颐、朱熹的学说。万历十七年(1589)中士，授行人职。四川佥事张世则呈他的著作《大学初义》，诋毁程颐、朱熹的章句，并请求颁行天下，攀龙上疏极力反驳他的错误，张世则这本书便没有颁行。

侍郎赵用贤、都御史李世达被别人攻击丢了官，袁中的议论多数归咎于大学士王锡爵。攀龙上疏说：

“近来朝廷之上，正人君被排挤一空。大臣则孙钅龙、李世达、赵用贤走了，小臣则赵南星、陈泰来、顾允成、薛敷教、张纳陛、于孔兼、贾岩被斥退了。近来李祯、曾乾亨又无法安心本职而乞求走了，选郎孟化鲤又借推荐言官张栋，随着这去了。

“天地之间造就一个人才是很难的，国家需要人才是很急迫的，这样的废置排斥，以后的人才怎么接得上。这些情况已使得正直的人扼腕叹息，邪的人弹冠相庆，世人心如此真叫人不胜慨！而且现在陛下的朝讲已经停止很久了，朝臣不能望见皇帝的龙颜。皇帝传旨下来，虽然说是圣上亲自裁定，但这里面隐藏了些什么，难以揣度其究竟，所以朝廷内外的舆论，不是说‘辅臣想除掉不归附自己的人’，就是说‘近侍不利用正直的人’。陛下居九重之内，也曾经把每位大臣是否贤能的情况写了陈列在左右；而陛下对于各臣，也曾想过他们为什么会获罪的原因吗？如果以为都是由于圣上发怒，可是各臣除孟化鲤之外，未曾听说有犯圣旨的，为什么都遭罢免斥退呢？即便违抗了皇帝讲了不中听的话，例如董基等，陛下已经录用，为什么对于这些人却不是这样呢？我恐怕陛下有驱逐邪的果断，而左右的人反而利用来实现自己嫉妒的私心；陛下有接纳言的博大怀，而臣反而留给您拒绝谏诤的讥嘲。传到各地，写史册，使圣德受累不浅。

“辅臣王锡爵等，看他自我约束的情况，好像胜过张居正、申时行；观察他的用心和五十步笑百步又有什么不同呢？即如各臣被罢退斥逐，如果以为当然是这样，那么是非邪正，一般人都能辨别，怎么忍心坐视皇帝的错误法，难不是为了发私愤，而得益于把那些人全都罢免斥退光吗？”

最后极力诋毁郑材、杨应宿说人坏话、结奉承应该罢免。杨应宿也上疏攻击攀龙，所讲的话非常荒诞，没有据。两份奏疏一起给院，议论的结果是请求对二人稍加责罚，以表示惩治过去，警戒未来。皇帝不准，降杨应宿二级，把攀龙贬职放到揭为添注典史。