河东游牧，雷龙偷偷由兴武发，袭击并攻破敌营，斩杀了许多人，王崇古被加封为右都御史。吉能侵犯边关，被执行秋季防守任务的队遏制了，他们移驻白城。雷龙等人奔池、长城关与他们作战，大败敌人。王崇古在陕西呆了七年，前后获得很多战绩。

从河以东到宣府、大同等边关之外，是吉的弟弟俺答、昆都力扎营放牧的地方。再向东到蓟镇、昌平以北的地区，吉、俺答的首领居住在那里，他们都很盛。俺答又收留了叛贼赵全等人，占据古丰州地方，招募数万名逃亡的人，让他们建屋定居耕田，号称板升。赵全等人尊奉俺答为帝王，替他筑城池，造殿；同时修造自己的府第，仪礼宛如王者，将门题称开化府。他日夜教俺答练兵法。由东面攻蓟、昌地区，向西劫掠忻、代地区，骑兵迫平、灵石，直到潞安以北。从嘉靖辛丑(1541)开始，扰边关达到三十年，边防大臣因为失利而被治罪的人很多，边患较陕西四镇为重。朝廷悬赏抓获赵全的人封官都指挥使，赏白银一千两，最终没有收获。边关的将士都贿赂敌寇谋求和平，有人还替敌人效劳；那些落敌手又自己逃回的人，却被边军杀冒功请赏；对敌情不知晓，但边军的动静敌人总是先知。隆庆四年(1570)正月，诏令王崇古统辖宣府、大同、山西地区的军务。王崇古禁止边军士兵擅自关，却放一向通敌的人敌营充当间谍。他又发檄文抚少数民族和汉族陷落敌手的军民，率众来降或者自己逃回的人，全行安抚。回归的人接踵而来。西少数民族、瓦剌、黄等一年之中有两千多人归降。

当年冬天，把汉那吉来投降。把汉那吉是俺答第三个儿铁背台吉的儿。从小失去父亲，由俺答的妻一克哈屯抚育。长大后婚娶大成比，但关系不好。把汉自己聘娶了我儿都司的女儿，称为三娘，也就是俺答的外孙女。俺答看到她貌，抢夺了她。把汉愤恨，又听说王崇古正在接纳归降的人，当年十月率领妻、儿女十多人归降。巡抚方逢时报告了此事，王崇古考虑趁此制服俺答，铲除赵全等人，将把汉等人留在大同，问安抚备至。他与方逢时上奏朝廷：“俺答在外横行了几乎五十年，威镇各，侵扰边关。现在神灵厌恶凶残，使他众叛亲离，不远千里来投降，应该给予住宅，授予官职，使衣丰盈，以便使他心中喜，严禁他们，以防备他们的欺诈。如果俺答到边寨来索取，就与他易，责令他将赵全等逆贼绑缚送来，遣返被俘虏的人，而后将把汉依礼遣返，为上策。如果他凶暴傲慢地兴兵动武，不理睬劝谕，就明白地告诉他准备杀戮他们，令他们屈服，俺答盼望他们活着回去，必然害怕我们死他们。他意志被抑神情沮丧，不敢大肆逞，然后再慢慢中了我们的计谋，是中策。如果他就将他们舍弃而不索求，就对把汉从厚优待，与他培养恩情和信任。他的下陆续来降，将他们安置在下，指派把汉统辖，大略如同汉代在乌桓设置属国的法。以后待俺答死了，他的儿辛必然拥有属。于是给把汉加封名号，命令他收集余，自成一。辛必然愤恨而争斗。他们两者相互僵持，则两者对我都有好，如果他们互相仇杀，那么我们兵不动，表示帮助。他们没有闲暇侵扰，我们就能休养生息，也是一策略。如果依照旧例将他们安置到海滨，使俺答每天窥视南方，不断侵扰；或者将他们分给各位将领，让他们随军立功，他们一向骄纵、富贵，不接受差遣，制严了，必然产生怨恨，顿生逃离之心，最后遭受反咬的祸患，这都不是办法。”

奏章呈上后，朝廷议论纷纷。御史饶仁侃、武尚贤、叶梦熊都称敌情叵测。叶梦熊引用宋朝收受郭药师、张珏的事情借鉴。兵尚书郭乾不能决定，大学士拱、张居正极力主张采纳王崇古的建议。诏令授予把汉指挥使的官职，赏赐一官服，而将叶梦熊废黜，调京城，以便平息反对意见。

俺答刚刚掳掠了西少数民族，听到事变急忙回师，调集辛的兵分路犯，急切地索要把汉，辛佯装发兵，暗中权衡利弊，所以俺答没能遂愿。一克哈屯思念她的孙，朝夕哭泣，俺答很忧患。巡抚方逢时派遣百鲍崇德到他的军营，俺答气势很盛地接待他，说：“自从我兴兵，镇将死了很多。”鲍崇德回答：“镇将怎么能与你的孙比？现在朝廷对待你的孙很优厚，你举兵是加速他的死亡。”俺答怀疑把汉已经死了，等到听说此话，动心了，派使者侦察。王崇古让把汉穿纟非袍束金带接见使者，俺答大喜过望，鲍崇德趁机游说：“赵全等人早晨送到，把汉晚上就能返回。”俺答很兴，屏退随从对他讲：“我不作，祸是赵全等人所为。现在我的孙归顺了汉族，是天意。天分封我为王，永远辖治北方，各落谁敢生祸？即使我不幸死去，我的孙应当世袭封爵，他接受了朝廷的厚恩，怎敢辜负呢？”就遣使者与鲍崇德一起回来，而且替辛请求官职，并请求行互市。王崇古都上报了，皇帝全答复可以。俺答就绑缚了赵全等十多人献给朝廷，王崇古也派使者将把汉送回。皇帝认为已经抓获叛贼，在郊庙祭祀，将赵全等人碎尸于集市。加封王崇古为太少保，兵尚书，总督原来的辖区。

把汉回去后，俺答和他的妻抚摸着他哭泣。派遣使者来答谢，发誓不侵犯大同。王崇古指令他要求土蛮、昆都力、吉能等族都朝贡，俺答答复遵命，只有土蛮没有朝贡。王崇古思量土蛮势力孤单，蓟镇、昌平可以无忧患，命令将士不要焚烧荒地、捣毁巢，商议开通贡市，使边地百姓休养生息。朝延议论又是哗然。尚书郭乾称先帝明令禁止市，不应该授意。给事中章端甫请求敕令王崇古不要追求前的功利，忽略了长远的考虑。