答，文渊才被释放，而令他退休。英宗复位，削去文渊被加封的官职。而景泰年间代宗的易储诏书中“父有天下传之”语自文渊，有人传言朝廷下令逮捕文渊，文渊害怕自缢而死。

这时乔新已考中景泰五年(1454)士，任南京礼主事，回乡奔丧。同乡人曾任侍郎的揭稽曾经师从文渊，而与乔新兄弟不和，他就诬奏文渊死实际是由于被诸迫而自杀，又嫁父亲妾。乔新也揭发揭稽任巡抚时曾经举荐黄。。，并且代为起草易换皇储疏。两人都被受审。文渊妾为此断指，为乔新兄弟诉冤，官司得以缓和。英宗也以揭稽所犯之事先前已赦免，就释放他不再问罪。事完以后，乔新又为母亲守丧，守丧期满，改任刑主事，调任广东司郎中。锦衣卫兵犯法，何乔新律理，一也不宽恕。都指挥袁彬托他办事，乔新执意不从。袁彬发怒，派人找诬告他的把柄，一无所得。由此乔新名声大震。

成化四年(1468)，他调升福建副使。所辖寿宁的银矿被非法开采，聚众千余人，到劫掠，乔新募兵去，擒获其首领。福宁豪族尤氏杀人，带着保镖和武，拒捕二十年。福清薛氏经常海与异国商人生意，事发后，策谋叛。都被乔新捕捉杀掉。福安、宁德银矿很久就无矿可开，有关门仍征收矿税，很多百姓以致破产。乔新来说话，减税三分之二。兴化百姓自洪武初曾向官府租用耕，直到这时每年仍要求纳租税，乔新上奏予以免除。清、归化里界于沙县、将乐之间，依恃地势险要，而不赋税，乔新告诉都御史设置归化县，此地百姓才开始受到约束。乔新调升河南察使。河南发生大饥荒，旧例，救济借贷到秋季为止，乔新说：“秋季，是说可以依靠秋收，今年秋季能依靠吗？”于是救济到第二年麦熟才停止。都御史原杰到南招抚民，带乔新前去协助。以前，项忠驱赶民过，民一听说原杰到了，更是躲山谷。乔新亲自前往招抚，登记簿籍的有六万多。升任湖广右布政使。荆州百姓为徭役所苦，乔新验实人贫富，分为九等，使百姓得到好。

十六年(1480)，乔新被提升为都察院右副御史，巡抚山西。边地军民总是伐木捕兽，他说：“这些人一旦遇到敌人，必定边防情况以求生都是敌贼的向导。应该不许擅自，有违犯的罪及守将。”宪宗下诏同意。敌人侵犯边，乔新同参将支玉在灰沟营设埋伏，击斩大量敌人，升左副都御史。年成不好，乔新奏免杂税以及盐税的十分之四。他弹劾佥事尚敬、刘源拖延调查审判，请求皇帝命令天下审判官员，案件拖延半年以上的要论官员之罪。宪宗称好，立即下诏。召乔新任刑右侍郎。山西发生严重饥荒，现人吃人的惨剧。乔新受命前去赈济，求活三十万多人，安置十四万离失所的人家。回朝，正逢发生安宁宣抚使杨友想夺嫡弟播州宣使杨的爵位，而诬告杨有异谋的事件。乔新前去调查，与巡抚刘璋一起洗清杨的冤屈。杨友被削官安置他府，播州人于是相安无事。

孝宗即位，万安、刘吉等憎恨乔新刚直正派，将其调到南京任刑尚书。沿江的芦洲全被宦官侵占，假托给皇帝备办用之费，乔新被调离朝廷，宦官怀恩觉得这事不公平。一天因事到内阁中说“：新君登位，应当任用正直的人，为什么调走何公？”万安等无话可说。不久刑尚书杜铭被罢免，众人都认为应由乔新代替，而刘吉代替万安任首辅，始终憎恨乔新，许久不以他补任刑尚书。改年号为弘治后，采用王恕的举荐，才召乔新代替杜铭。乔新奏：“旧制，派遣官员调查案情，以及实行逮捕，必须携带详细批文，到所在官府验察后才执行。近来只用一般传帖而不合符契。应该恢复旧制，以防矫诈。”孝宗立即批准了。这时刘吉仇视正直人士，频繁制造大案件，乔新一律依据法律纠正。刘吉愈加仇恨他。几次寻找借削去乔新俸禄。二年(1489)夏季，京城大，乔新请求抚恤受灾人家，又考虑到刑法失平，奏陈律文当变更的几件事，刘吉一概加以阻拦而不实行。大理丞官职缺人，御史邹鲁图谋升迁此官，而乔新推荐郎中魏绅。时逢乔新舅家与乡人打官司，邹鲁即诬告乔新接受贿赂包庇舅家人。刘吉从中取旨将其舅家人下诏狱，乔新于是上疏要求返乡。不久，追究底终归拿不证据，邹鲁因诬告被停发俸禄，也同意乔新退休。

乔新为人清廉。他在工负责时，曾去淮西视察。巢湖县令阎徽年青时从师于文渊，就赠乔新金币。乔新不收，阎徽说“：这是为我师祝寿的。”乔新说“：你要为我父亲祝寿，通过他人送给父亲可以，通过我送给父亲则不行。”终究不接。福建市舶宦官死了，镇守者将其资财分送三司，独有乔新持不收。不得已，送国库。辞官在家时，杨遣使赠送厚礼，并且献棺材的上好木料，乔新决不收。

乔新十一岁时，随父在京城居住，修撰周旋来访，乔新正在读《通鉴续编》。周旋问他“：此书比起《纲目》在取材和对人评价上有什么不同？”乔新回答“：吕文焕向元朝投降而不写叛变，张世杰投海殉国不说是死节；曹彬、包拯之死不写其官职，而记述伏羲、轩辕多采怪诞，似乎不恰当。”周旋大为吃惊。长大成人之后，博览群书，听说有珍奇的书总是借来抄，积累三万余函，都是经他自己校雠，著述甚多。不大与人来往，气节与彭韶相投，学问与丘浚谈得来而已。

罢归后，巡江西御史陈诠上奏：“乔新始终保持节，中间只有接受亲戚送礼之嫌疑，而被勒令辞官，这样退不明的理实在可惜。请前往调查，如该官无病则予以任用，如有病就加以劳，以留存对故旧的恩惠，保全退的节。”孝宗不答应。后来朝廷内外许多官员上疏推荐何乔新，孝宗始终不再起用。十五年(1503)乔新去世，终年七十六岁。

江西巡抚林俊为彭韶及何乔新请求赐谥号，吏也提此请求。孝宗下旨令呈报乔新退职的原因，给事中吴世忠说“：乔新的学行、施政办事都很不错，忠诚，勤奋，刚正耿直，年龄越大越如此。御史邹鲁挟私仇诬告他，他一词不辩，坦然退职归乡，闭门著书，少与人来往，士大夫没有谁不赞赏他的品行。如果一定要考察退职的原因，怀疑表彰贤才原则的误用，那就像宋代蒋之奇曾经诬奏欧修，胡。。之辈曾诬奏朱熹，未听说以一个人的私情而废万世公论。”事情终究未成。正德十一年(1516)，广昌知县张杰又为乔新说话，才赠封乔新为太太保，准予其袭乔新官爵。第二年赐谥号文肃。