又命群臣修反省。六月初三，畿南大闹饥荒，当地官吏请求赈济，未得到及时答复。当月，阁臣法官奏请审，未得答复。

秋七月初一，日。初五，吴南因丁服父母丧事离职。这一年，两畿、河南、山东、山西、陕西、江西、湖广、福建、广东遭灾。暹罗、乌斯藏曾来朝贡。

万历四十六年(1618)二月十五日，赈济广东饥荒。

夏四月十五日，大清军队攻克抚顺，千总王命印战死。二十日，总兵官张承胤领兵救援抚顺，也全军覆没。闰月初二，杨镐担任兵左侍郎兼右佥都御史，经略辽东。六月二十六日，京师地震。这年夏天，官吏奏请审，未得到答复。

秋七月二十日，大清军队攻占清河堡，守将邹储贤、张旆战死。八月十六日，朝廷将军饷海运到辽东。二十四日，乃蛮等七落请求与朝廷相通。二十五日中止行刑。九月初七，守辽军队缺乏粮饷，有关官员奏请拨用各省税银，未得到及时答复。二十六日，加派天下田赋。三十日，京师发生地震。

冬十一月初九，因灾异频繁而令群臣修反省。十二月初二，河落首领猛克什力前来投降。这一年有土鲁番、天方、撒儿罕、鲁迷、哈密、乌斯藏前来朝贡。

万历四十七年(1619)二月十一日，经略杨镐在辽誓师，总兵官李如柏、杜松、刘纟廷、林分。三月初一，杜松在吉林崖遭遇大清军队，战死。初二，林在飞芬山战败，兵备佥事潘宗颜战死。初七，刘纟廷率军阿布达里冈，战死。十八日，赐庄际昌等人为士及第以及其他不同。

夏四月二十日，盔甲厂发生火灾。六月十六日，大清军队攻克开原，林全军覆没。二十二日，大理寺丞熊廷弼担任兵右侍郎兼右佥都御史，经略辽东。二十三日，朝廷大臣聚于文华门，奏请皇帝批复奏章以及增派援军和分发粮饷，未得到答复。

秋八月初五，山东蝗灾。十三日，逮捕杨镐。九月初一，中止行刑。初九，百官跪伏于殿阶下，奏请朱翊钧上朝理政事，未得到答复。

冬十月初八，赈济京师饥民。十二月，又加派全国田租赋税。二十二日，镇江、宽奠、云爰新募援兵被击溃。这一年有暹罗前来朝贡。

万历四十八年(1620)正月二十一日，朝鲜请求救援。三月十二日，再次加派全国田租赋税。

夏四月初六，皇后王氏死去。十一日，朱翊钧病发，在弘德殿召见方从哲。

秋七月十七日，朱翊钧病情加重，在弘德殿召见英国公张惟贤，大学士方从哲，尚书周嘉谟、李汝华、黄嘉善、张问达、黄克缵，侍郎孙如游，勉励各位大臣勤政敬职。二十一日，死去，时年五十八岁。遗诏停止一切榷税和新增织造等。九月初十，追加尊敬谥号，庙号神宗，安葬于定陵。

神宗范天合哲肃敦简光文章武安仁止孝显皇帝，叫朱翊钧，穆宗第三。其母为李贵妃。

隆庆二年(1568)，被立为皇太，当时年方六岁。翊钧少年聪慧，穆宗曾驰中，他谏：“陛下为天下之主，独骑而骋，宁无衔橛忧。”穆宗大喜，下大加抚。陈皇后病居别，翊钧每晨随母前往探问，皇后每听到脚步声就兴起来，并挣扎着坐起，取经书考问他，翊钧总是声回答，其母李贵妃也十分兴，两因此而越来越和睦。

隆庆六年(1572)五月，穆宗驾崩。六月初一，日。初十，朱翊钧继承皇帝之位。定第二年为万历元年，颁诏大赦天下。在乡间祭祀建文朝尽节诸臣，有孙后代的加以恤录。十六日，罢免拱。二十三日，仪死去。二十八日，礼尚书吕调兼任文渊阁大学士，参预机要事务。

秋七月初四，漕运初通至密云。初七，考察京师官员。十五日，告诫朝廷诸臣“：近年来，士习惯于浇薄，为官之礼法被削弱，诬蔑老成为无用，骄狂者便佞为有才。于是使朝廷赋予的权力，仅仅成为人臣报复的资本。虽需要加以惩戒，但我都予以宽恕。诸臣应力改前过，共维新政。若仍沉溺于故习，背公徇私，获罪于祖宗，朕不敢赦免。”十七日，尊称陈皇后为仁圣皇太后，李贵妃为慈圣皇太后。八月初五，祭祀大社大稷。九月十一日，将庄皇帝安葬于昭陵。

冬十月初六，侍郎王遴、吴百朋、汪昆分别巡视边防。初八，中止行刑。十一月十三日，河工完成。十二月初九，赈济榆林、延绥饥荒。二十二日，以穆宗驾崩不久为由，下诏免设元夕灯火及中宴席。

万历元年(1573)二月初二日，听取经筵讲解。三月十六日，诏令内外官员举荐将材。

夏四月十六日，、惠贼寇被平定。二十一日，天大旱，谕百官修反省。五月初五，诏令内外官员慎重行刑狱之事。六月二十四日，赈济淮安灾。

秋七月，黄河在徐州决。九月初六，赈济荆州、承天及济南灾害。初九，四川都掌蛮被平定。二十六日，中止行刑。

冬十一月初四，朱翊钧诏令诸司订立章程限制文书上报时间，以防延迟缓慢。十二月十三日，赈济辽东饥荒。

万历二年(1574)正月十八日，朱翊钧在皇极门召见朝觐廉能之官。二月初九，赈济四川被贼寇侵扰诸县。三月十八日，赐予孙继皋等人士及第以及其他不同的。

夏四月二十二日，朱翊钧诏谕百官行久任之法。五月二十八日，穆宗牌位附于太庙。八月二十八日，赈济山西灾害。二十九日，赈济淮、扬、徐灾。

冬十月十三日，审理囚犯。二十六日，上朝办公审阅选官制度。闰十二月二十日，下诏免去第二年元夕灯火。当年，琉球前来朝贡。

万历三年(1575)正月初七，祭献太庙。二月初九，祭祀大社大稷。十二日，诏令南京职务应简为宜，官吏不得虚占其位以充数。二十七日，开始命日讲官分别记注起居，纂辑章奏，临朝值班。

夏四月初一，日，为日全。初四，翊钧书写谨天戒、任贤能、亲贤臣、远嬖佞、明赏罚、谨、慎起居、节饮、收放心、存敬畏、纳忠言、节财用十二事置于座右侧，以期自警。五月初三，淮、扬发生大灾，于是他诏令审察二府官吏，罢免了有贪污等老病的官员。六月初一，浙江海泛滥。十一日，命抚、官员，官吏是否贤能一并举荐和弹劾，不得偏重甲科士。当年夏天，苏、松、常、镇普发大。