黎元洪则说：“徐秘书长未免欺人太甚！”

一个月后，孙洪伊为整顿内务，裁减了里的三十多名职员。由于这些被裁者大都和北洋系的脑脑有着这样或那样的关系，他们岂能善罢甘休，而徐树铮也想利用他们来把孙洪伊给搞下去，于是便怂恿他们向平政院上诉。结果，平政院裁定撤销内务原令，被解职的那些人仍旧回去上班。

平政院是袁世凯时期设立的一个政治仲裁结构，孙洪伊不但不接受这样的裁定，反认为平政院是一个非法机构，随后他拟将此案提国会审议。徐树铮害怕国会接受孙洪伊的意见，于是决定先下手为，他在经过老段的同意后拟定了一执行平政院裁决的命令，准备总统府批准。

徐树铮的这命令，不但内务总长孙洪伊拒绝副署，黎总统也拒绝盖印，府、院之间反复争执，酿成**。老段自上次就对孙洪伊十分不满，于是暗地里给孙传话，让他辞职算了。但是，孙洪伊非但认为自己没有错，而且气十分，拒不辞职。

老段这回真动怒了，他在十月中旬下了一将孙洪伊免职的命令，让小徐拿给黎总统盖印。黎总统见后十分震惊，决不肯用印。徐树铮为这事来回跑了四趟，黎总统连拒四次，丝毫不肯让步。最后一次，徐树铮威胁黎元洪说：“总统不肯盖印也无妨，以后我们不准孙洪伊参加国务会议！”黎总统大怒：“你说的这是什么话？！”徐树铮冷笑：“什么话？这是段总理的原话！”

过了几天，很少到总统府的段总理突然气呼呼的现在黎总统的面前，他拿着将孙洪伊免职的命令给黎元洪，说：“总统要是不肯免孙洪伊的职，那就把我免职了吧！”

老段下了最后通牒，黎总统也只好退让，不过他还想给双方留余地，也给自己争回面，于是他建议：“免职令还是不下的好，让他自动辞职吧！我来给他工作！”

偏偏孙洪伊这位也是个死派，他死活不肯主动辞职，还大声嚷嚷：“什么官我都可以不，只要维持我的人格！我不辞职，不洋，不外调！”

黎总统也说服不了他，这下事情闹僵了。一方面，要是不把孙洪伊赶内阁的话，段总理的面没地方放，以后也就没了威信；另一方面，孙总长持自己没有错，主动辞职就是失却人格。双方都不肯妥协，把黎总统夹在中间，左右为难，束手无策。

最后，黎元洪只好把北洋系的大佬徐世昌给请来，希望他来调解这个纠纷。徐世昌是个老官僚，见多识广，他一就看了其中的问题所在。于是，徐世昌提一个方案，那就是将孙洪伊和徐树铮同时免职，原总统府的秘书长张国淦任国务院的秘书长。张国淦与府院之间的关系都不错，由他任国务院秘书长的话，双方的沟通就相对好很多了。