那为什么不直接将其删除，还要派机章鱼攻打？

事实上，机城和zion同在一个虚拟世界里，必须遵守一样的规则，而章鱼的攻打，实际上正是在执行对zion的删除。

方雅君又问，如果zion是虚拟的，那为什么那些人类不能再分辨了？

这是因为他们和source世界中机生命的对抗，已经使他们没有怀疑的力和必要了，再说本来source世界就是真实世界的反映

方雅君最后又问，如果都是虚拟的，那么真实的世界是什么呢？

对于这个问题，杜星河只能讲，其实和source世界差不多， source世界所储存的都是真实世界的信息，惟独的区别是，其中source世界生的行为受到系统权限的规定，真实的世界也并没有什么抵抗组织，所有活着的人都被泡在营养里面。一开始所有的人都被设置在矩阵系统里面，但后来鉴于某些人的反抗情绪会导致矩阵系统运行的不稳定，就把这些人的大脑都接真实机世界中智能程序运行的那个系统中。影片中把这个系统称之为source，其中设立了zion，把那些反抗者集中到这个系统中来，并使其成为一个矩阵化的工。architect是现实的型电脑理程序以个智能生命份现在矩阵中的形式。

杜星河最后给方雅君总结，机和人类其实是共生关系，机的原本计划就是这样的：机从人类那里获得能源，机提供人存活的营养。人类的思维生活在机创造的matrix中。

但这个计划暴了两大缺：

1，并不是所有人类都愿意生活在matrix中。

2，并不是matrix中的所有程序都是为机原来的目的而存在的。

由于存在这两情况，matrix必须是一个能不断升级的系统，于是the-one被设计了来，机的想法是：在现实中建造锡安城，让只愿生活在真实中，而不愿生活在matrix中的人都集中到锡安，并让the-one加到他们的行列，收集这分人不愿生活在matrix中的原因，然后摧毁锡安城。让the-one回归matrix系统心，完善matrix系统，最后reload matrix系统行升级，减少不愿生活在matrix中的人的数量，最终使所有人都愿意生活在matrix虚拟世界中。

the-one是程序，由oracle（先知）植、唤醒并引导，这一次the-one被植在neo的思维中了。

在matrix系统中现的不为设计者原来目的而存在的程序，原来的法。这样的程序是一定要被删除的（如那个小女孩）。在机看来，人类没有选择。人类的思维必须生活在matrix虚拟世界中。

对于不愿生活在matrix中的人来说，他们认为生活在matrix是人类被机役，人类必须生活在真实中，机必须被消灭。