丁担任司徒，就征召士壹。士壹一到，丁已被免职，黄琬接替他为司徒，对士壹也极为礼待。董卓作，士壹逃归故里。州刺史朱符被少数民族的人所杀，州郡秩序混。士燮于是上表奏请任命士壹兼任合浦太守，二弟徐闻县县令士黄有兼任九真太守，士黄有弟士武，兼任南海太守。士燮格宽厚有量，谦虚下士，中原士人前往他避难依附者数以百计。他专心诵研《秋》，为它作注解。

陈国人袁徽给尚书令荀彧的信说：“阝止士府君既学问优博，又通晓治政，于大之中，保全一郡之地，二十余年疆界内没有战祸，百姓不失其业，商人行旅，都蒙受他的好。即如窦保全河西之地，也不能超过他！理公务的余暇，他还研习书、传，尤其对《秋左氏传》的研析简练微，我曾多次就该书中的一些疑难之向他询咨，他都能举以师说，解释甚为详密。对《尚书》他能兼通古、今文，对其中大义理解十分详备。听说京师古文经学派与今文经学派，各以为是争辩不休，他现在正打算分条论析《左氏秋》、《尚书》的正确涵义上奏。”士燮受人称赞即是这样。士燮兄弟一起担任各郡郡守，有力地掌着一州之政，因偏在万里之域，故其威望尊贵至无上。他们鸣钟响磬，备威仪，笳箫鼓，车骑满，常有几十位胡人夹在车群中焚香。他们的妻妾都乘坐有盖、帷的小车，弟都有兵士骑跟在后，当时他们的尊贵显赫，震服各少数民族，以往的南越王尉他(即赵佗)也不能超过他们。士武最先因病去世。朱符死后，汉朝廷派遣张津为州刺史，张津后来又被自己手下将领区景所杀，而荆州牧刘表派遣零陵人赖恭前往接替张津。其时苍梧太守史璜死亡，刘表又派遣吴去接替史王黄，与赖恭一同到达。汉朝廷听说张津已死，就赐予士燮有玺印、封号的书信说：“州地与中原隔绝之，南面依江面海，朝廷之恩不能宣达，臣下之言受到阻，得知逆贼刘表又派赖恭窥视南土，现在以士燮为绥南中郎将，总督七郡，兼任阝止太守照旧。”后来士燮派遣州吏张郃带着贡品前赴京都，正是天下大之时，路隔绝，而士燮没有放弃贡的职责，皇帝特意再次下诏任命他为安远将军、封爵龙度亭侯。后来吴与赖恭两人失和，吴起兵驱逐赖恭，赖恭走逃回零陵。红网

建安十五年(210)，孙权派遣步骘为州刺史。步骘到州后，士燮率领兄弟们接受节制调度。而吴怀有异心，步骘将他斩杀。孙权加任士燮为左将军。

建安末年(219)，士燮遣送儿士貵去作人质，孙权任命士貵为武昌太守，士燮、士壹在南方的儿们，都被任为中郎将。士燮又诱引益州的豪族雍闿等人率领郡中百姓，遥远之地向东依附孙权，孙权更加嘉赏士燮，升任他为卫将军，封爵龙编侯，升士壹为偏将军，封都乡侯。士燮常常派遣使者去拜见孙权，献各香料和细纹葛布，动辄就是数以千计，其他如明珠、大贝、琉璃、翡翠、玳瑁、犀角、象牙之类珍品，以及奇异果，及香蕉、椰、龙之类，无岁不贡。士壹有时贡献好几百匹。孙权总是亲自致信，厚加恩赐，以之回报抚他们。士燮在郡职位上四十多年，黄武五年(226)，九十岁时去世。

孙权考虑到阯偏僻遥远，于是分合浦以北为广州，以吕岱为刺史；阯以南为州，以良为刺史。又派遣陈时接替士燮为阯太守。吕岱留在南海，良与陈时一同前往合浦，而士燮的儿士徽自任为阯太守，派自己宗族亲兵抵抗良。良留在合浦。阯人桓邻，是士燮举荐的官吏，他叩劝谏士徽派人迎接良，士徽大怒，用鞭将桓邻打死。桓邻哥哥桓治和儿桓发又集合宗族亲兵攻击士徽，士徽闭城门拒守，桓治等攻打数月不能攻下，于是订约和亲，各人退兵回去。而吕岱接到诏书要诛杀士徽，自广州率领兵卒日夜赶驰，经过合浦，与良一前行。士壹的儿中郎将士匡与吕岱有老情，吕岱代任士匡为师友从事，先写信给阝止，向士徽告知利害，又派士匡前去见士徽，劝说他归服认罪。虽然失去郡守的官职，但却保他别无忧虑。吕岱随士匡之后到达，士徽的哥哥士祗、弟弟士、士颂等六人，赤膊跪迎吕岱。吕岱答谢还礼让他们重新穿上衣服，前往郡府下。第二天一早就布置帐幕，请士徽兄弟依次，宾客满座。吕岱站起，手抱符节宣读诏书，历数士徽的罪过，左右随从于是反绑士徽等推帐幕，当即全死，将其首级传送到武昌。士壹、士黄有、士匡后来来平叛，孙权赦免了他们罪行，他们以及士燮送作人质的儿士貵，都被贬为平民。几年后，士壹、士黄有因违法而被死。士貵病死，无儿，其妻寡居，孙权诏令其地官府每月供应她俸米，赐钱四十万。