百人的首级，齐人便撤兵了。祖整顿队班师南归，派记室参军刘本仁向江陵报捷。

七月，广陵的侨居百姓朱盛、张象偷偷地组织人袭击齐的刺史温仲邕，派使者来报告消息，祖率领队渡过长江接应他们。正碰上齐人遣使来访，要求割让广陵地方，王僧辩许诺了他们，并报告给祖，祖便率军退回南徐州，江北的人随着军队南迁的有一万多。秉承皇帝旨意授祖使持节、散骑常侍、都督南徐州诸军事、征北大将军、开府仪同三司、南徐州刺史，其他都如故。等到王僧辩率队去湘州征讨陆曲，秉承皇帝旨意命产祖代为镇守扬州。十一月，湘束王在江陵即位，改大实三年为承圣元年。湘州平定，祖随即镇守京。三年三月。祖之位为司空，其他依旧。十一月，酉魏攻陷了堰，直担和王乸等人言退守江州，请晋安王以太宰份总理朝政，又派长史谢哲上书劝。十二月，晋安王从寻到京城，住禁，赐给祖班剑仪仗二十人。四年五月，齐送还贞侯萧明执掌社稷，王僧辩接纳他，贞侯即位，改年号为天成，立晋安王为皇太。当初，齐人请梁接纳贞侯时，祖认为不妥，派使者与王僧辩力争，往返好几次，王僧辩始终不听从。祖常常愤慨叹息，秘密地对亲信人说：“武皇虽然是像磐石一样不可改易的宗主，声气遗传于四海，但说到为国雪耻，拯救困苦，衹有孝元能到，他的功业很大，是历代都没听说过的。我和王公都受了朝廷重托，先皇的语音还在耳边回响，哪料到今天竟有不测的图谋。嗣主是祖的孙儿，元皇的儿，海内众人瞩目，天下万人归心，有什么过错竟然遭到废黜，现在却从遥远的夷族求回王，设立君主失掉了先后之序，看到这样的情形，也就知将来的命运了。”就秘密地准备了几千件衣袍和绸缎金银等，作为赏赐用品。九月壬寅日，祖召集徐度、侯安都、周文言等人谋划，又排列将士，分别赏赐金银丝帛，从陆两路一齐发。这天夜间从南徐州发征讨王僧辩。甲辰曰，祖率军步行到石城前，派勇士从城北攀墙而。当时王僧辩正在办事，外面报告说有敌兵。很快兵士就在城裹现了，僧辩连忙逃走，和他的第三个儿王憔遇见了，都了小门，旁边还有几十个人，苦苦相战。祖率领大队人很快就到了，僧辩寡不敌众，逃跑登上了城南的门楼，祖藉着风放起火，僧辩无路可走，就被擒获。这天夜裹吊死了王僧辩和王颔。丙午日，贞侯让位，百官尊奉晋安王上表劝他登临帝位。十月己酉日，晋安王即位，改承圣四年为绉泰元年。壬日，韶令授祖侍中、大都督中外诸军事、车骑将军、扬南徐二州刺史，持节、司空、班剑、鼓都如故。仍然令祖带甲仗一百人，可随意廷与台省。

霆刺史拄鑫占据昱堡，和盏堡太守皇载一同起兵谋反。祖命令周文育率兵去义兴攻打韦载，拄鑫派他的堂弟韭圣领兵抵抗，丝业战败回到义兴。辛未，祖上表要亲自东征，留下州刺史侯安都、石州刺史杜棱守卫台省。甲戌日，大军到达义兴。丙日，掉了叛军的中木栅。秦州刺史徐嗣徽藉着这城齐国，又约好南豫州刺史任约一起举兵响应杜、韦载，齐国人供给他们兵卒和粮。徐嗣徽等人以为京城兵力空虚，率领兵五千人悄悄来到都城，侯安都带领五百名骁勇善战的士兵迎战，徐嗣徽等人退守石城。丁丑曰，韦载和杜北叟前来投降，祖安抚并释放了他们。因为徐嗣徽叛军威胁都城，就领兵回京城，命令周文言兵征讨杜。十一月己卯日，齐国派兵五千人渡河占领了姑熟。祖命令合州刺史徐度在冶城寺建立木栅，向南一直修到淮河边。齐国又派安州刺史翟崇、楚州刺史刘仕荣、淮州刺史柳达率领一万人，在胡墅渡河运来三万石米和上千匹，运了石城。癸末日，产担派堡室垫带领军夜袭胡墅，烧毁了齐国的一千多艘船，周铁虎率领军的船队截断了齐军的运输，抓住了他们北徐州刺史领州，缴获粮船上的几千石米。于是派韦载在大航建造土城，让杜棱据守。齐人又在仓门的河南岸立了两木栅来抵挡官军。甲辰曰，徐鱼丑邀等人攻打迨球的营栅，直担带领锐的铁甲骑兵，从西明门袭击他们，叛军大败溃逃。徐嗣邀留下柳崖等人守城，自己率领亲近的心腹将士，去南州采石，迎候齐人的援军。十二月癸丑日，直祖派侯安都带领军，袭击徐嗣徽在秦塑的家属，抓住了数百人。官军把船只连起来堵住河，切断了叛军的路。在造之前从十一月丙戌起太白星就隐没了，乙卯日才现在东方。丙辰，祖命令所有的军兵，立即渡河接近迨越，攻打它河南岸的两营栅。柳达等人渡过啦摆开军阵，直担督兵力战，放火烧毁了敌军的木栅，烟尘遮蔽了天空，敌军溃败，争夺船只相互推挤，溺死的人就有几千。当时百姓都在幽两岸观战，呼声震动天地。官军乘胜追击，无不以一当百，把敌军的船只全缴获，敌军大受震慑。这天徐嗣徽、任约等人率领齐的陆军兵一万多人，回到石城，祖派兵去江宁，占领险要地带以切断叛军通路。敌军兵步兵都不敢冒然前，驻扎在江宁浦，祖派侯安都率领军打败了他们，徐嗣徽等人乘着小船脱逃走，他们所有的军资械都被收缴了。己未，官军从四面攻城，从辰时到酉时，先占领了东北的小城，到夜间官军仍然围困不解。庚申日，柳达派使者侯钦、刘仕荣等到祖这边求和，祖允诺了他们，就在城门外杀牲订立盟约，叛军的下均不追究，随他们解散。辛酉曰，祖石城南门，列兵数万，送齐人回北方。

壬戌，齐和州长史乌远从南州回奔历。江宁县令陈嗣、黄门侍郎曹朗据姑熟城谋反，祖命令侯安都、徐度等人讨伐平定，砍下数千人，聚成土丘。石、采石、南州都被平定，收获的船只米粮匹武不可计数。

当月杜龠献城投降。二年正月癸未，在吴兴杀了杜，杜的堂弟杜北叟、司沈孝敦都被赐死。

二月庚申日，祖派侯安都、周铁虎率领舰队在江州防卫，仍然驻兵梁山建造营栅。甲，韶令司空如有军事，可以骑城内。戊辰曰，前任宁远石城公外兵参军王位在石城沙中得到四枚玉玺，祖上表送朝廷。

三月戊戌日，齐国派军仪同萧轨、库狄伏连、尧难宗、东方老、侍中裴英起、东广州刺史独孤辟恶、洛州刺史李希光，和任约、徐嗣徽等人，率领十万军队栅，向梁山兵，帐内主黄丛迎击，打败了他们，烧毁了他们先队的战船，齐军驻守芜湖。祖派定州刺史沈泰、吴郡太守裴忌去侯安都，一起固守梁山。

从去年冬天到这时，甘屡次降在钟山、撞尘、直泅和旦、江宁县等地，有的多达三升，大小像棋，铋上表报告朝廷。