，夜袭长谐，义军不利。太宗用数百游动骑兵突袭贼人后，桑显和军溃败，义军军威重振。

九月八日，冯翊太守萧造率他的州郡来投降。九月十日，祖亲率众围河东，屈突通自己守不，祖于是命令攻城，不胜而回。文武将吏请祖兼任太尉，加设属官，祖同意了。华令李孝常以永丰仓城来投降。九月十二日，祖率军渡过黄河，住在长。三秦地方的士和百姓前来投奔的每天有上千人，祖对他们加以礼遇，礼遇都超过他们所希望的程度，人人都很喜悦。十八日，派陇西公建成、司刘文静屯兵在永丰仓城，并同时守卫潼关，以防备其他人偷盗抢劫。太宗率领刘弘基、长孙顺德等前后数万人从渭北向三辅攻并宣告命令，义军所到之，全攻下。祖的堂弟神通从。。县起兵，柴氏之妻从司竹起兵，至此都与太宗会合。。。县贼酋丘师利、李仲文、銩稨、贼酋何潘仁等，聚集数万之众来投降。二十七日，命令太宗从渭。。发屯军阿城，陇西公建成从西丰急攻霸上。祖率大军从下圭阝西上，经过隋炀帝行园苑，将它们全撤除，女放还给亲属。

冬十月四日，到长乐，有众二十万。京师留守刑尚书卫文升、右翊卫将军世师、京兆郡丞仪挟持代王侑而抗拒义军。祖派遣使者到城下，以挽救危亡国家之义忠告他们，反复再三，三人都拒不答复。诸将决请求包围城池。十一月九日，攻克了隋朝京城。卫文升先已病死，因为世师、仪等人抗拒义军，都斩首。十六日，率领百官，准备好天乘舆车驾，立隋之代王侑为天，远远地尊奉隋炀帝为太上皇，大赦，改年号为义宁。十七日，隋帝下诏赐予祖假黄钺之生杀大权，使他持节大都督总朝廷内外所有军事事宜，大丞相，晋封为唐王，总领所有国家日常事务。以武德殿为丞相府，改变于皇上的“教”，为行使于下的“令”以陇西公建成为唐国世；太宗为京兆尹，改封为秦公；姑臧公元吉为齐公。

十二月七日，丞相府设置长史、司录等以及以下的官员。金城贼首薛举侵扶风，命太宗为元帅攻打他。派遣赵郡公孝恭在山南招安抚，所到之，全接受招安。十七日，太宗在扶风大破薛举的众。屈突通从潼关向东都逃窜，刘文静等在阌乡将其追上擒获，俘虏贼众数万人，河池太守萧王禹率州郡归降。三十日，派云县令詹俊、武功县正李仲衮军蜀并宣布政令，攻下了蜀。

义宁二年(618)正月二十二日，世建成为抚宁大将军、东讨元帅，太宗为副，共领兵七万，攻打东都并宣布政令。二月，清河贼酋窦建德超越本分号称为长乐王。吴兴人沈法兴占据丹起兵。三月十一日，右屯卫将军宇文化及在江都杀隋太上皇炀帝，立秦王浩为皇帝，自称为大丞相。迁徙改封太宗为赵国公。二十三日，隋帝晋祖为相国，总领百官政务，准备赐给祖九神，以示尊。唐国设置了丞相以下的官员，在长安通义里建立了皇祖以下四庙。

夏四月七日，停止用竹而改用符，在所有郡颁发银菟符。二十四日，世建成及太宗从东都胜利班师归来。五月一日，隋天诏令祖可以享有天之冠冕有十二旒，建立天旌旗，清和警戒。王后、王女封爵封号，一律遵循旧的规章。十四日，隋帝遣使持节、兼太保、刑尚书、光禄大夫、梁郡公萧造，兼太尉、司农少卿裴之隐捧皇帝玉玺给祖。祖辞让，百官上表章敦请祖登位，以至于两次、三次敦请祖登位，这才听从众议。隋帝退居旧代王官邸。改大兴殿为太极殿。二十日，祖在太极殿即皇帝位，任命刑尚书萧造兼任太尉，在南郊祭祀天地，大赦天下，改隋朝义宁二年为唐朝武德元年。官吏都赐爵一级。义军所到之，免除赋税徭役三年。撤销郡而设置州，改太守为刺史。二十三日，在太极殿宴请百官，官阶等级赐予绸缎。东都留守官共同立隋越王侗为帝。二十八日，命相国长史裴寂等人修订法令。

六月一日，太宗为尚书令，相国府长史裴寂任尚书右仆，相国府司刘文静为纳言，隋民尚书肖王禹、相国府司录窦威二人都任内史令。废除隋朝《大业律令》，颁布新的法律条令。六日，准备皇帝的车驾，迎接皇祖宣简公以下君主牌位，附祭于太庙。追谥妃窦氏为太穆皇后，陵墓称作寿安。七日，立世建成为皇太。封太宗为秦王，齐国公元吉为齐王。封宗室蜀国公孝基为永安王，国玄为淮王，长平公叔良为长平王，郑国公神通为永康王，安吉公神符为襄邑王，国德良为长乐王，上开府素为竟陵王，上国博。。为陇西王，奉慈为渤海王。诸州总加封号为使持节。十日，封隋帝为餋国公。薛举侵泾州，命令秦王李世民为西讨元帅征讨他。改封永康王神通为淮安王。十九日，加秦王为雍州牧，其余官职依旧。二十八日，内史令窦威去世。

秋七月三日，刑尚书萧造为太太保。追封已故皇玄霸为卫王。西突厥派遣使者前来表示归附。秦王与薛举在泾州大战，我军大败。