不哭，朝廷知其跋扈，又因为他藏老的沙的事，在三月二十七日下诏书罢免了孛罗帖木儿的兵权，安置于四川。孛罗帖木儿抗拒不从，杀死朝廷使臣，遣将会同秃帖木儿带兵攻打京城，扬言要朝廷右丞相搠思监、资政院使朴不二人。

原先，朝廷立卫屯田，曾命中书右丞也先不领，与秃帖木儿分院之地相近，因侵扰了秃帖木儿的乡里，产生嫌隙，也先不便暗中向朝廷报告说秃帖木儿攻击朝政。孛罗帖木儿与秃帖木儿是老相好，知也先不的话是诬陷，便派人向朝廷说明秃帖木儿无罪。这时皇太早到孛罗帖木儿跋扈，现在又与秃帖木儿相勾结，藏匿不轨之臣，于是与丞相搠思监商议，请皇上下诏书解除他的官职，将他的兵分一分由四川省丞相察罕不率领。孛罗帖木儿见诏后，认为这不是皇上自己的意思，拒绝听命，并发兵帮助秃帖木儿。

四月九日，孛罗帖木儿居庸关。十二日，至清河扎营，行将犯京师。皇帝遣达达国师、蛮院使至清河问明兴兵犯京师的理由，乃下令驱逐搠思监与朴不两人于岭北和甘肃，这实际便是将两人执送于孛罗帖木儿。十七日，秃帖木儿自健德门京，在延阁会见皇帝，痛哭请罪，皇帝设宴勉，并下诏赦其无罪。并仍以孛罗帖木儿为太保、中书平章兼知枢密院事，守御大同；以秃帖木儿为平章政事。十八日孛罗帖木儿返大同，皇太愤怒不已，再召回扩廓帖木儿兵，使保卫京师。

五月，皇帝诏令扩廓帖木儿为总兵，并调各之军分讨大同。扩廓帖木儿自其父察罕帖木儿在时，就与孛罗帖木儿连年仇杀，朝廷多次派人调解，两军才还兵各守其地。现在，扩廓帖木儿发兵与诸兵夹攻大同，并调下锁住守护京师。因兵不满万人，又以其下青军杨同佥守居庸关。扩廓帖木儿自带兵至太原调督诸军。

七月，孛罗帖木儿率兵与秃帖木儿及老的沙等攻京师，京师震骇。二十五日，皇太亲自带兵迎战于清河，丞相也速、詹事不兰奚带兵至昌平。因也速之兵士无斗志，青军杨同佥被杀于居庸，不兰奚败走，皇太亦跑回城去了。二十六日夜，锁住迫胁东官僚随太奔太原，二十七日孛罗帖木儿兵至，驻健德门外，追袭皇太，老的沙竭力制止。三人见顺帝于宣文阁，泣拜诉冤，顺帝也哭了，赐宴。二十九日任命孛罗帖木儿为太保、中书左丞相，老的沙为中书平章政事，秃帖木儿为御史大夫。属将士，分布在台、省，总揽国家大权。

八月一日，顺帝下诏加封孛罗帖木儿开府仪同三司、上国、太保、中书右丞相，节制天下兵。数月间，杀佞臣秃鲁帖木儿、波迪哇儿。。等，停止三不急需的建筑，淘汰宦官，减省钱粮，禁西番僧人佛事。还数次遣使请皇太回朝，但当使者至太原后，太反将使臣拘留起来。

二十五年，皇太在外，日夜谋除内，调遣岭北、甘肃、辽，陕西及扩廓帖木儿军，讨孛罗帖木儿。孛罗帖木儿怒，将皇后逐外，幽禁一百天。又派遣秃帖木儿率军征讨在上都的归附皇太的人。调也速南御扩廓帖木儿军。也速到良乡后停止前，回到永平，并派人西联太原、东联辽、军势大振。孛罗帖木儿担心也速大，便派骁将姚伯颜不带兵抵御。至通州，河涨，便在虹桥扎大营，也速其不意，袭击、打败伯颜，并擒而斩之。孛罗帖木儿大恐，自己带兵到通州，因连下三天大雨，只好返回京师。孛罗帖木儿先曾因自己多疑而杀自己的将领保安，现在又失去姚伯颜，便有些郁郁不乐，每日和老的沙饮宴，荒无度，酗酒杀人，喜怒无常，人皆畏之。威顺王的儿和尚，受皇帝密旨，与徐士本合议，连结勇士上都、金那海、伯颜达儿、帖古思不、火儿忽达、洪宝宝等，谋行刺孛罗帖木儿。