再也不能这么就算了。十五年，容宣抚司同知田世瑛，上奏说他已获得一枚镇南军民府的古印，是南宋开禧皇帝在开禧二年(1206)颁发给他的始祖田始的，因此请求将现在的宣抚司改升为军民府。礼大臣讨论认为，设置宣抚司后，颁给的印章时间已很长，不应当变更了，而那枚古印应该上缴朝廷。皇上同意。

嘉靖七年(1528)，容宣抚司、龙潭安抚司每次上朝贡都率领千人随行，他们所经过的地方都受到扰害，凤巡抚唐龙把此事报告给了礼。礼认为旧的制度，来献贡时随行的人不能超过一百，到京城来随行的人不能超过二十，命令有关官府重新申明这个制度。忠孝安抚司的把事田带领几十个人声称自己去朝廷献贡，一路上却伪造关文，扰驿传，应天巡抚将此事报告了兵。兵大臣讨论认为土司违反惯例来献贡，且对所经过的地方横加勒索，恐怕有其他意图，应该严禁他们这行为。二十六年，腊峒等地的长官司来献贡，礼检验他们的印章文书时发现有伪造现象，就下诏革除给他们的奖赏，并让下面的大臣调查实此事。

嘉靖三十三年(1554)，皇帝下诏让湖广、四川、贵州的总督共同理容十四司的事务。原先，容土官田世爵与土官向元楫世代有仇。向元楫年幼时，田世爵假装要与向元楫家讲和通好，便把女儿嫁给向元楫，实际上是谋侵夺向元楫的财产，因此便诬告向元楫是邪恶作伪之人。有关官府恐怕激起变，就让田世爵自己去捕捉向元楫，以死罪名义把向元楫投监狱。田世爵便率兵攻打向元楫，把向氏家族的人全俘获，把向氏家族的土地全登记没收，并自己的名下。时间一长，宣抚了解了他的谋，责令他与向元楫一起对质。田世爵不但不来对质，还暗地里与罗峒的土舍黄中等人一起密谋反叛朝廷。这样湖广巡御史周如斗就请求到荆南去巡察施州卫，以便控制该地区，又要求征调守卫广西清狼的军队来充实这里的兵力。皇帝把这个上疏给督臣冯岳等人去讨论。冯岳等人给皇帝说“：施州地偏僻孤悬，不能长期在那儿驻扎军队，况且守卫的军队也不是一时间就能集中的，因此应当把荆瞿守备移到施州，把九溪、永州两地的守备移到九溪，在上荆南备巡察官。至于田世爵骄横一世，官府已经无法驾驭约束他，单单把向元楫关在牢里有什么用？我们认为应该假借督臣的权威来控制容宣抚司的权力，向田世爵问抗拒官府的罪行，如果他还不悔改，就把他绳之以法。”皇帝同意这个建议。

此时，龙潭安抚黄俊素来贪婪凶暴，占据支罗峒寨，常因小怨小忿就杀人，所以获罪被投监狱。这时正好碰上白草番造反，黄俊的儿黄中请求去立功为父亲赦免罪行，之后又请求自己当副指挥，贿赂主此事的官员答应此事。黄俊狱后更加骄横，与黄中和群盗李仲实等人一起在四川的云、奉节之间横行霸。副使熊逵等人用计擒获了黄俊和李仲实。黄俊死在狱中，黄中自己把自己绑起来来投降，并把自己的余党谭景雷等人也绑起来给官军，为自己赎罪。皇帝命令追戮黄俊的尸，把他的脑袋割下来示众；把李仲实等人以斩刑；把黄中贬谪到边关去搞守卫；奖赏有功人员。嘉靖三十五年(1556)，因田九霄在浙江黄宗山抗击倭寇有功，皇上任命他继承容宣抚的职位，赐给他红。。衣一袭。

隆庆元年(1567)，吏科给事中朱绘等人上奏说，湖广施州卫的忠路安抚覃大宁一天上奏五次，言语多与事实不符，请求皇上追究他的责任；都察院也有意见，说金峒安抚土舍覃璧与人争印而相互仇杀，以及磁峒不应当归四川辖等。皇帝全把这些情况给抚官去勘察后再上报。四年，覃璧叛，打伤了官军，抚官请皇帝追究失事的各位大臣的罪行。兵上奏说“：本施州卫孤零零地在境外，覃璧作的事发生得又很仓猝，所以应该从宽赦免他们，让他们在以后建功。”皇帝同意，命令有关官府相机剿或招抚叛的人。五年，巡抚刘悫在平定了覃璧的叛后，向皇上陈述了五条建议“：一、请求把川东所辖的巫山、建始、黔江、万县改为隶属于上荆。二、荆州离施州卫太远，不便于巡察。在夷陵西面有傅友德攻打蜀地时所开辟的旧路，名叫百里荒，离施州卫只有五百多里。请求让东的石石主承担巡检的职责，把施州卫的州门驿、三会驿一起转移到近的地方，以便百姓之可以相互联络。在百里荒和东卜垅仍然创建哨堡，命令一员千，监督一百班军守卫该地方。三、施州卫地域广阔，产最为丰富，卫官大肆剥削，致使百姓逃跑，发生叛。应该裁减通判设置同知，让他们招抚治理汉民和蛮族人，使当地的徭役、赋税均平合理，不再额外横加索取。四、金峒世代相传的官位不应该让其突然断绝，宽免覃胜的罪行，把他从安抚降为峒长，让他听从支罗所百的调迁。五、施州所辖的十四个司，应当继承官舍的，一定要先向院讲明，才能理事务。如有人擅自立名号，请求严厉治罪，同时请求皇上命令巡的军队每年都从施州经过。在军队经过时，预先调集各官舍行奖赏，再让他们去看军队巡，以便他们看后受化。”皇上都同意了他的意见。

万历十一年(1583)，湖广抚给皇帝上奏：“施州卫的施南等宣抚司各官，仍然听从镇。。参将的节制，希望皇上把这个写敕书里，以便统一理事务的权限。”皇帝同意。