二十二年(1389)晋升为尚书。第二年五月，诏令在京为官三年的都能升迁，并成为规定。太祖要刑尚书赵勉和杨靖换官职，谕曰：“百姓犯法，就如饮一样容易。设法防范，违犯者越多。推恕行仁，或许能化。从今开始，犯有十恶罪并杀人的一律死，犯其他罪的都让他们向北边输粟。”又说“：在京城的囚犯，你等应复奏，我亲自审决，尚怕有所失误。在外地的官吏所思量的，又怎么能全面呢？你们应详细上奏，然后派遣官吏审决。”杨靖领旨研办，大多数得以平反。太祖予以嘉奖，并采纳了他的意见。曾抓了一武弁，卫兵搜了他的，得到一颗大珠，属僚十分惊异。杨靖却慢条斯理地说：“这是假的，怎么能有如此大的珠呢？”于是将珠打碎。太祖听说后，叹：“杨靖的这个举动，有四值得称。不把它敬献给我以讨得喜，这是其一。不穷追投献，这是其二。不奖励门卫，杜绝了小人的侥幸心理，这是其三。千金之珠猝然而至，毫不动心，说明杨靖有过人之智，应变之才，这是其四。”

二十六年(1393)兼任太宾客，并给予二份俸禄。不久，犯罪被免职。正遇上征讨龙州赵宗寿，诏令杨靖晓谕安南为军队输送军粮。杨靖穿上白衣前往。安南相黎一元以陆运险艰为由，不奉行诏令。杨靖反复宣讲谕令，并允许他运。一元于是输送粮二万石至沲海江，另造浮桥到达龙州。太祖十分兴，任命杨靖为左都御史。杨靖公忠而有智略，善于理繁杂的事务，治狱明察而不事文。他得到的遇最丰厚，同行没有人可与他比。三十年七月因为乡人代改诉状而犯罪，被御史弹劾。太祖大怒，于是赐他死罪。终年三十八岁。

单安仁，字德夫，濠州人。少年就担任府吏。元朝末年，江淮兵荒，安仁召集义兵保卫乡里，元朝廷授予他枢密判官。跟从镇南王孛罗普化镇守扬州。当时群雄四起，安仁叹：“这些人都是为渊驱鱼，为虫驱雀罢了，王者兴起，不会是这样的。”镇南王被长枪军赶跑，安仁没有归属，听说太祖平定集庆，就说“：这才是王者。”率众前去归附。太祖十分兴，就命令他率军镇守镇江。安仁严格整顿军队，敌人不敢犯。移守常州，他的儿叛降了张士诚，太祖知安仁忠谨，也没怀疑他。一段时间后，晋升为浙江副使。有悍帅横敛百姓，名目叫寨粮，安仁绳之于法。晋升为察使，征召为中书左司郎中，辅佐李善长裁断政事。调任瑞州守御千，任将作卿。

洪武元年(1368)，提升为工尚书，仍统领将作事务。安仁，足智多谋，诸多营造工程，大小及程式，十分符合太祖的心意。过了一年改任工尚书，因年老请求还乡。赐给三千亩田，七十，每年供给尚书俸禄的一半。六年，任山东参政，恳切推辞，得到许可。回老家闲居，曾上奏请求疏通仪真南坝至朴树湾的，以便利官民运输，疏通运河江都港以防止淤，迁移瓜洲粮仓至扬桥西，以免受大江风的侵害。太祖认为他的建议很好。再次授予他兵尚书。他辞官不。最初，尚书官阶是正三品。十三年，中书省撤消后，尚书升为正二品，但安仁辞官在此之前。太祖念及安仁的功勋，二十年，特授予他为资善大夫。当年十二月，安仁去世，终年八十五岁。

薛祥，字彦祥，无为人。跟从俞通海前来归附，渡长江时担任寨军镇抚，多次从征有功。洪武元年(1368)，转漕至河南。半夜抵达蔡河，盗突然到来。薛祥不为所动，好语劝散了盗。太祖听说后十分兴。派他带兵，任职十分卖力，授予京畿都漕运使，负责淮安。浚河修筑堤坝，自扬州到济南长达数百里，徭役分担十分均平，百姓没有什么怨言。有功劳的立即上奏，授予官职。元朝都城被攻下，官民纷纷南迁，途经淮安，薛祥多方给予方便。山、海州民，驸都尉黄琛前去平定，牵连了许多人。薛祥会同审讯，无罪的就当场释放。薛祥治理淮安八年，百姓都称赞他。到他任期满后回京城时，百姓焚香希望他再来，有的还祭祀他的肖像。