十六日，逮捕张经下狱。六月十九日，兵侍郎杨宜总督军务，征讨倭寇。

七月十三日，倭寇攻陷南陵，窜抢劫芜湖、太平。二十四日，侵犯南京。八月三十日，苏松巡抚都御史曹辅在浒墅打败倭寇。九月三日，赵文华及巡御史胡宗宪在陶宅攻击倭寇，官军失败。十四日，俺答侵犯大同、宣府。二十六日，侵犯怀来，京师戒严。二十九日，参将芳在保安打败俺答。当年秋天，减免江北、山东受灾秋粮。

十月二十九日，杀张经及巡抚浙江副都御史李天、兵员外郎杨继盛。三十日，倭寇侵掠宁波、台州，侵犯会稽。十一月初一日，有日。二十九日，倭寇侵犯兴化、泉州。闰十一月十六日，免畿内灾税粮。十二月四日，开山东、四川银矿。十二日，山西、陕西、河南发生大地震，渭、黄河涨，淹死八十三万余人。

这年，琉球来朝贡。

嘉靖三十五年(1556)正月二十二日，官军在松江与倭寇战斗中失败。二月五日，赈救平、延安灾害。十日，杨宜停职。二十九日，吏尚书李默因犯诽谤罪被下锦衣卫狱死。巡抚侍郎胡宗宪总督军务，征讨倭寇。三月十八日，赐诸大绶等士及第、各有不同。

四月八日，赈救陕西灾害。十六日，倭寇侵犯无为州，同知齐恩英勇战死。二十三日，游击宗礼在崇德攻击倭寇，官军溃败。五月八日，赵文华提督江南、浙江军务。三十日，左通政王槐在玉旺峪采集银矿。六月九日，总兵官俞大猷在黄埔打败倭寇。十四日，俺答侵犯宣府，杀游击张。。

七月二十五日，胡宗宪在乍浦大败倭寇。八月十六日，下诏采集灵芝。二十五日，胡宗宪打败海盗徐海于梁庄。九月十日，徽王朱载土仑犯罪，废为庶人。免南畿受灾税粮。二十七日，因平定浙江倭寇，祭告郊庙社稷。

十月初一日，有日。十一月三日，打来孙侵犯广宁，总兵官殷尚质等英勇战死。十二月二十二日，侵犯环庆。

嘉靖三十六年(1557)二月，俺答侵犯大同。三月二十九日，把都儿侵犯迁安，副总兵蒋承勋奋力战死。这月，吉能侵犯延绥，杀副总兵陈凤。

四月十三日，奉天、华盖、谨三殿发生火灾。十九日，下诏自己承担责任，修整五天，停止各官吏封事，停止用刑。五月一日，倭寇侵犯扬、徐二州，山东境内。十一日，在四川、湖广采伐木料。十九日，倭寇侵犯天长、盱眙，于是攻泗州。二十四日，侵犯怀安。六月四日，兵备副使于德昌、参将刘显在安东打败倭寇。十三日，停开陕西矿场。

七月十九日，下诏广东采集珠宝。九月，俺答之辛侵犯应、朔二州，捣毁七十余堡。

十一月二十八日，辛包围右卫城。这年冬天，减免山东、浙江受灾税粮。

当年，琉球来朝贡。

嘉靖三十七年(1558)正月十四日，停开河南矿场。三月二十三日，开始减免三大营厅征调官军营造工役。

四月四日，赈救辽东饥荒。六日，倭寇分侵犯浙江、福建。

八月十五日，吉能侵犯永昌、凉州，围攻甘州。

十月十日，礼献吉祥灵芝一千八百六十棵，下诏广泛采集直径在一尺以上的。十一月十四日，告诉法官抚恤刑狱。

这年，琉球、暹罗来朝贡。

嘉靖三十八年(1559)二月二十八日，把都儿侵犯潘家，渡过滦河，三屯营。三月七日，抢掠迁安、蓟州、玉田。十八日，赐丁世等士和不同。二十一日，倭寇侵犯浙东，被海副使谭纶打败。二十二日，逮捕浙江总兵官俞大猷。

四月六日，倭寇侵犯通州。十三日，攻福州。十九日，攻淮安，被巡抚凤都御史李遂打败于姚家，倭寇退守庙湾。二十五日，副使刘景韶大败倭寇于印庄。五月十日，逮捕总督蓟辽右都御史王忄予下狱。二十三日，刘景韶在庙湾大败倭寇，平定江北倭寇。六月五日，辛侵犯大同。

八月二十日，李遂、胡宗宪在刘家庄打败倭寇。二十五日，赈救辽东饥荒，给耕和粮。这一月，俺答侵犯土木，游击董国忠等英勇战死。九月，侵犯宣府。