沛霖倔淮北，当张洛行伏诛，惧，请散练归农。及僧格林沁北行，又袭攻埠、怀远、寿州，围蒙城，皖军不能制。至是僧格林沁督军讨之。陈国瑞先至，连战皆捷，匪党丧胆。十月，大军亳州，连克蒋集、杨家寨。与陈国瑞合攻，绝其粮，破蔡家圩，淮河两岸贼垒悉尽。沛霖昏夜越壕窜，为其党刺杀。总兵王万清斩首以献，逆党苗憬开等均伏法。寻破西洋集，擒匪首葛元，颍、亳、寿境圩寨悉定，淮甸渐清。

时捻匪张洛行之侄总愚扰河南，令苏克金率队往会剿，而降捻李世忠，官至江南提督，素跋扈，盘踞淮南，将为隐患。诏曾国籓密为置，命僧格林沁驻军镇慑。三年，世忠自请解兵柄。会汉南粤、捻诸匪纠合下窜，与张总愚相应接，将图南犯，为江宁踞贼声援。僧格林沁乃督师赴许州，南，与河南、湖北诸军会剿，迭破贼于信、应山、郧之间。六月，江宁克复，大赉诸军，诏嘉僧格林沁转战勋勤，加一贝勒，命其伯彦讷谟祜受封，复以所蒙古队最得力，保举素无冒滥，命择尤奏奖，赏兵丁银一万两。

七月，粤、捻诸匪麕聚麻城，令苏克金、张曜、英翰等分路击，破贼垒数十。捻首陈得才以万众来扑，战于红石堰。苏克金力战，歼贼甚众，遽病暍卒，以成保代之。贼窜麻城南境闵家集，结垒为固，成保攻破之。总兵郭宝昌克蔡家畈，贼窜河南光山、罗山。僧格林沁亲督队追击，战于萧家河，援贼大至，稻陇地狭，队失利，自翼长舒通额以下，阵亡将领十二人。八月，复战于光山柳林寨，先胜，中伏，为贼所围，力战始退，总兵扬阿死之。九月，张总愚东窜，与上河、蕲州之贼勾合，踞风火山，僧格林沁会鄂军剿，连战破之。贼趋安徽境，分窜潜山、太湖、英山。十月，连破之于土漠河、乐兒岭、陶家河。匪目黄中庸率千人来降，追至黑石渡，令黄中庸为前锋，袭贼营，大军继之，冲贼为两段，贼目温其玉等率九千馀人投械乞降。侦知贼分三路，遣兵分剿，捻首和率党七万人投诚，原为前敌。贼党甘怀德诱擒伪端王蓝成献，磔于军前。馀党汪传第、吴青泉、吴青泰、范立川等各率众乞抚，先后受降十数万人，著名匪首仅存数人。陈得才寻亦穷蹙自尽，惟张总愚、陈大憙西窜河南、湖北境，复猖獗。

十一月，僧格林沁督军追剿，败之于光山境，至枣。粤匪赖文光、邱元才，捻匪洛红、任、李允等窜踞襄黄龙垱、峪山，官军击小挫，而张总愚、陈大憙乘间与合，图犯樊城。大军追击于邓州唐坡，贼倾巢扑，两面包钞，官军失利，伤亡甚多。僧格林沁自请严议，诏宽之，乃驻军南。十二月，贼由南召、鲁山窜踞宝丰张八桥。大军，令郭宝昌、何建鼇分南北两路，恆龄、成保以队护之。北路贼而营，贼来扑，成保横钞袭，乘胜压过山冈；南路诱贼，从旁更番击：两路皆捷，合军追击，直抵张八桥。贼夜遁山，北趋河、洛。僧格林沁督军由洛取宜，驻韩城镇。

四年正月，贼折而南犯鲁山，大军追及，战于城下。前锋得利穷追，后路为贼钞袭，翼长恆龄等阵亡。舒保、常顺队接应，陈国瑞横突扼桥上，始得全师退，而舒保、常顺亦以伤殒。贼遂窜叶县、襄城，陈国瑞乘雪夜袭攻，纵火焚之。贼东北窜新郑、尉氏，追及于双溪河，翼长诺林丕勒等击走之。贼南趋，由临颍、郾城扰西平，裹胁愈众，遂犯汝宁。二月，僧格林沁抵汝宁，贼由息县、罗山窜信。大军抵信，贼又北窜，追至确山。陈国瑞等步队亦到，令与全顺、何建鼇、常星阿、成保数路合击。郭宝昌设伏山，僧格林沁登山督战，诸悍贼齐集，合力死斗。国瑞鏖战最力，宝昌伏起冲突，贼大败，尸横遍野，由遂平、西平、郾城、许州、扶沟直走睢州。官军追至，又奔山东境，渡运河至宁，折向曲阜。