城南行郊劳礼，赐御用鞍。还京献俘，御紫光阁，行饮至礼，赐紫缰、四开褉袍。

初，阿桂去云南，缅甸遣使议贡，械送京师下狱。至是诛索诺木母人，上命释缅使令观，译告以故，纵之归，冀以威武风动之。四十二年，署云贵总督图思德奏：“懵驳已死，赘角牙立，输诚纳贡，原归中国人。请开关通市。”上以事重，当有重臣相度受成，命阿桂往莅。五月，授武英殿大学士，理吏，兼正红旗满洲都统。缅甸使不至，遣苏尔相等归，遂召阿桂还。未几，缅甸内。又十馀年，国王孟陨表祝上八旬圣寿，定十年一贡。南徼始安。

四十四年，河决仪封、兰，奉命往。阿桂令开郭家庄引河，筑拦黄坝；又于下王家庄，筑顺黄坝：蓄势，溜直引河。四十五年三月，堤工蕆，还京。兼翰林院掌院学士。旋命勘浙江海塘，筑鱼鳞石塘、柴塘，及范公塘。四十六年，工成，命顺勘清江陶庄河堰石工。

甘肃撒拉尔新教苏四十三与老教仇杀，戕官吏。总督勒尔谨捕教首明心下狱，同教回民二千馀夜济洮河犯兰州，噪索明心。布政使王廷赞诛明心，贼愈炽。上命阿桂视师，时阿桂犹在工。命和珅往督战，失利。贼据龙虎、华林诸山，险隘。阿桂至，设围绝其，攻之，贼大溃。歼苏四十三，馀党奔华林寺，焚之，无一降者。甘肃冒赈事发，命治，尽得大小官吏舞弊分赇状，谳定，疏请增设仓廒，广储粮石，以济民。

秋，河决河南青龙冈，命自甘肃赴河南会河总督李奉翰督河。故事，河决，当决两端筑坝，渐近渐合，谓之“合龙”十二月，两坝将合，副将李荣吉谓势盛，宜缓，阿桂督之急。既合，属吏贺，荣吉独不至，召之，则对使者曰：“为荣吉谢相公，坝不可恃，不敢离也。”越二日，果复决，阿桂驰视。荣吉已堕，悬千金赏救之起，解御赐黑狐端罩覆之。因上疏自劾，请别简大臣董其役，上诏答，略曰：“近年诸臣中能胜治河任者，舍阿桂岂复有人？惟当安心静镇，别求善策。”四十七年，奏请于下游疏引河，上游筑大堤，并于北岸建坝，迫溜南趋。四十八年，工始竟，诣河行在，复命仍赴工次，审定章程。

浙江布政使盛住疏论总督陈辉祖籍王亶望家有所私，命阿桂如浙江治。还，又命勘江南盐河，又命勘河南兰十二堡堤工，并于村建闸。四十九年，甘肃盐茶？回民张阿浑据石峰堡以叛。上遣福康安、海兰察等讨之，复命阿桂视师。两月馀，破堡，戮张阿浑等，加一等轻车都尉世职。又命督河南睢州堤工。五十年，举千叟宴，阿桂领班。又命勘河南睢州河工，并察洪泽湖、清形势。五十一年，又命勘清堤工，并如浙江仓库亏缺，勘海塘；又命勘江南桃源、安东河决。再如浙江治平知县黄梅重徵，论如律。

五十二年，又命督睢州十三堡河决。时台湾民林文叛，上命福康安讨之，谘阿桂军事。阿桂疏论师当扼要害，分并，先通诸罗，廓清后路，自大甲溪兵。谕曰：“所见与朕略同，已谕福康安奉方略。”睢州工竟，又命勘江南临湖砖石堤工。五十三年，又命湖北荆州灾。请疏窖金洲以导，修万城堤以护城。五十四年，命再勘荆州堤工。嘉庆元年，宗内禅，阿桂奉册宝。再举千叟宴，仍领班，于是阿桂年八十矣，疏辞领兵。二年八月，卒，仁宗临其丧。赠太保，祀贤良祠，谥文成。