族武装已经秘密组成了一支20万人的新军，拥有2983机枪，442门大炮，120辆战车，分别编为19个步兵师，5个骑兵师，和一个机械化师，统归西线司令伊斯迈特将军指挥。至此，大反攻的准备工作已接近完成。土军的反攻计划是由凯末尔亲自拟定的，要是：在南路，以主力先肃清希军的外围据，而集中攻打阿菲永一卡拉希萨尔和杜姆卢波纳尔一带的希军右翼集团，并对其主力队实施合围。北路军团的使命则是，突破敌人的正面防线，尽可能地向厄斯基希尔和布尔萨方向实施追击。为了保证战役的胜利，土军的战前准备是在极其秘密的状态下行的。

1921年8月26日凌晨，反攻战役开始。总司令凯末尔、西线司令伊斯迈特和总参谋长费夫齐亲临科曼台培地实施指挥。在土军大炮的猛烈轰击下，希军前沿工事一个个被摧毁。炮火准备后，土军装甲队行突击作战，中华帝国的先武装备得到了发挥，钢铁洪迅速突破希腊军队的防线，随后土军步兵跃敌军战壕展开搏战，而骑兵则从侧翼包抄希军。

日暮时分，希军阵地已被突破，土军乘胜对阿菲永发起迅猛攻击，于次日占领该城。在厄斯基希尔前线，土耳其的一个军也攻破希军防线，迫使希守军向西撤退。希腊军队的境十分不利。由于统帅在撤离与守的问题上犹豫不定，安纳托利亚前线的防务得不到应有的重视。当土军开始攻的时候，希军总司令哈詹尼斯斯甚至不在前线，而是远在伊兹密尔度假。希腊zhèng fǔ撤消了哈詹尼斯斯的职务，由前线军团指挥特雷库斯接任总司令。此时希军的右翼集团在土军的攻势下已然大，特雷库斯实际上已经无法履行总司令的职责了。

8月29日，土军已将希军右翼集团退往伊兹密尔的后路切断，有5个师的希腊军队在杜姆卢波纳尔地区遭到包围。土军在凯末尔的指挥下发起攻，希军大被歼，只有8000人在特雷库斯的率领下突重围赶到乌沙克。乌沙克一带地势险峻，特雷库斯准备在此建立防御阵地，以掩护希腊残军向伊兹密尔撤退。但是土军不容希军有半息之机。

9月2日，正当特雷库斯与其参谋人员在军营中计划布防的时候，一支土军骑兵突然现，将指挥的所有人员一齐俘获，该路希军自此彻底失败，乌沙克遂被土耳其人收复。由凯末尔亲自指挥的南路围歼战战果辉煌，它在土耳其历史上被称为“总司令战役”

南路战役之后，土军主力立即兵分两路，一路向伊兹密尔方面继续实施追击，另一路沿铁路北上，合北路土军夹击厄斯基希尔，并将驻守该地的希腊1个军大消灭。

9月初，屈塔希亚亦被收复。土耳其军队怀着昂扬的斗志继续追歼希军，力图全歼侵者。北路土军于9月5日收复了布尔萨，又在尔拉海滨的穆达尼亚俘获了希军的1个师。之后，该军的1个纵队向南收复了勒克西尔，锋芒直指达达尼尔海峡边缘的查纳卡累。南路土军则连续攻占了阿拉谢希尔、萨利赫利等地，于9月9日占领了伊兹密尔。少数希军逃到海边，在英国人的帮助下渡海逃回了希腊。

至9月18日，20万希腊侵军已被从安纳托利亚全肃清，自1920年起放在大国民议会主席团桌上作为志哀标记的黑桌布，被和平岁月中的绿桌布所取代了。

当土耳其军队在小亚细亚西岸追击希军，而迫近黑海海峡的时候，协约各国到十分恐慌。英国人一面虚张声势地行战争准备，一面建议土耳其暂停军事行动。凯末尔得到中华帝国的保证，向土耳其提供军事保护伞，因此对英国人的恐吓不予理睬。于是，法国人只得伪装成土耳其的友，并以协约国所有国家全权代表的资格向凯末尔保证说，土耳其将不战而收回东雷斯，凯末尔这才同意缔结停战协定，下令军队停止前。